f(x)= .... Coronavirus Covid-19

Tu as regardé les travaux du professeur Leung de HK ? (j'avais mis les liens)

edit : tiens en reparlant de lui je viens de voir qu'il vient de publier un article dans le NY Times

@Pieyre : cette page wikipedia de timeline du coronavirus, présente les données séparées basées sur celles "published by the National Health Commission of China".

Edit : mainland China only, of course. Les autres régions ne distinguent pas (encore?) les cas totaux des cas en cours.

Tigrou, oui j'avais lu le premier article. Mais on ne peut pas dire que ce soit une information qui passe dans le grand public. Ce qui me paraît important, c'est que la carte de la JSU passe sur tous les médias sans que les commentateurs distinguent bien ce qui est actuel et ce qui est cumulatif.

Topsy, d'accord, c'est une page qui est peut-être davantage consultée; mais son seul graphique comptabilise uniquement les cas de façon cumulative.

Maintenant, je reconnais que le nombre total de cas est important a posteriori pour caractériser l'incidence d'une épidémie. Mais, dans la perspective d'une information destinée à des décideurs comme au grand public, il me semble que c'est avant tout le nombre de cas actuellement contaminés qui importe. Cela rejoint la distinction que j'ai tenté de faire entre ce qui est urgent et ce qui est important.

@Pieyre : sorry, j'avais mal compris ton message. Je ne pensais en effet qu'à une source de données brutes, et pas à une visualisation des données, et encore moins à celles qui visent un large public.

Pour faire comprendre ce que je veux dire, voici les modélisations que j'obtiens ce jour, la gaussienne et la polynomiale.





Oui, je sais : si j'avais été plus doué, je les aurais fait figurer sur le même graphique. Mais c'est comme ça.

Bon, alors, il s'agit dans les deux cas des contaminations actuelles (et non pas cumulatives). Ce qu'on peut remarquer, c'est qu'elle convergent (alors qu'auparavant la seconde indiquait un pic bien supérieur à la première). Il ne s'agit pas d'une prévision, mais d'une extrapolation convergente. Forcément, comme le faisait remarquer quelqu'un (Confiteor sans doute, mais je ne suis pas doué non plus pour les attributions), à la fin, on finira par tomber juste, et on n'aura aucun mérite à cela. Mais, justement, le fait que deux extrapolations convergent, n'est-ce pas une indication pour penser qu'on se rapproche de la fin, enfin au moins du pic des contaminations effectives ?

A chaque fois c'est le nombre de nouveaux infectés ou le nombre total d'infectés par jour ?
Est-ce que le nombre de morts est retranché du nombre des infectés ?

J'aime bien tes modèles Pieyre.

Les 2 courbes sur le même graphique

Siamois, c'est le nombre d'infectés actuels (enfin, non : c'est juste celui qu'on peut déduire de données sujettes à caution). Et, oui, le nombre de morts est effectivement retranché.

Stegos, merci : tu as utilisé Gimp ?

les morts sont peut etre tjr infectés

Pieyre a écrit:Stegos, merci : tu as utilisé Gimp ?

Yup, 2 layers, un avec transparence à 50%, je n'ai pas ajusté au pixel, j'ai fait ça en 30 sec

"Etonnant vivant, cnrs editions" p.74. (Chose étonnante, je n'ai pas trouvé de copyright pour ce livre, sauf quelques images d'auteurs.)

La découverte du premier virus à la fin du XIXe orienta fortement le choix de sa définition, en 1960.
Voici les 4 critères discriminant un virus :
1) C'est un micro-organisme parasite intercellulaire obligatoire (hors d'une cellule, il est inerte).
2) Les virus se reproduisent par leur seul génome.
3) Ils ne se divisent pas.
4) Ils ne peuvent pas convertir l'énergie chimique des aliments en énergie utile pour créer de nouveaux constituants (pas de métabolisme).

Du point 4, il découle que les virus ne sont pas vivants.

En 2010, les chercheurs invalident les critères 2) et 4).
2) le seul génome ne suffit pas à initier le parasitage d'une cellule, il faut une molécule complexe pour le faire dans la plupart des virus.
4) on a découvert "des bactéries parasites intracellulaires obligatoires ne possédant pas le métabolisme nécessaire à leur réplication."

La frontière vivant/non-vivant devient alors floue pour les virus.

Découverte des pandoravirus en 2013, par une équipe française.


Le pandoravirus a une forme d'amphore, comme la boîte de Pandore originelle. Il contient environ 2'000 gènes. Pourquoi autant de gènes, car il suffit de 4 gènes pour créer une enveloppe à certains virus ?
On peut comparer le pandoravirus à un ovule ou un spermatozoïde - qui contiennent "un génome de 3 milliards de nucléotides" - pouvant transformer un organisme en un autre organisme dédié à la réplication du virus. Si les virus, quelque soit leur taille, sont des graines, alors l'infection est l'ensemencement.
Conclusion : pour beaucoup de chercheurs, les virus sont vivants ! (p.79)

Incroyable, n'est-ce pas?

C'est la définition du vivant qui est en jeu et pas seulement celle du virus. Si on considère que l'unité fondamentale du vivant est la cellule, le virus s'en trouve exclu.

alors les bactéries et les archées aussi !

Selon moi, cela peut perturber les croyances en pratique mais pas dans le principe, si l'on considère que la vie n'est pas plus définissable que le libre arbitre. Métaphysique, quand tu nous tiens !

Très bonne question ! Qu'est-ce qui fait vraiment que nous sommes vivants ?

Pour l'instant les règnes du vivant sont en effet : Bacteria ; Archaea ; Protista ; Fungi ; Plantae ; Animalia (parfois Archaea et Bacteria sont réunis dans un même règne : Monera). Ce ne sont bien que des découpages, dont la justification n'est pas toujours pertinente (en particulier pour les Protista, le "groupe poubelle").

J'ai dit faux, bactérie et archées sont aussi des cellules...

Tim

1) Intercellulaire? Tu as probablement voulu dire intracellulaire.
2) ils utilisent la machinerie d’une cellule pour la lecture de leur code génétique et créer des virions. Voir 3
3) ils ne se divisent pas mais se multiplient en utilisant la machinerie et l’énergie de la cellule parasitée.
4) Un virus peut être inerte mais ne l’est pas de manière permanente comme un objet puisque la faculté de multiplication est une caractéristique du vivant.

La question du vivant/non-vivant n’est pas tranchée.

La question du vivant/non-vivant n’est pas tranchée.

A l'heure actuelle, une définition du vivant, un découpage de ses règnes, sont tranchés. Et les virus sont exclus du vivant (ou alors dites-moi dans quel règne ils sont mis).

A l'avenir, il est probable qu'un continuum soit à considérer du "non-vivant" au "vivant", en passant par une gamme d'intermédiaires. Cela correspondrait mieux au nouveau découpage du vivant en lignées phylogénétiques, plus pertinent que le découpage traditionnel en règnes, embranchements, classes, etc. A noter que ce dernier découpage reste et restera pertinent pour un certain type de représentations. Mais pas par rapport à la définition du vivant par exemple.

Et on fait quoi des prions ?

Confiteor a écrit:Et on fait quoi des prions ?

Ben, on les repasse bien et on les range

sauf erreur, ce sont des molécules mal pliées, donc ce qui marche pour les T-shirts, hein...

qui ont la propriété de provoquer leur réplication par une cellule mais sans code génétique.

Dans la mesure où ce sont des protéines, je les considère juste comme des molécules. Mais elles ont en effet la capacité d'induire les malformations d'autres protéines. C'est un peu comme le jeu de chat perché, où le chat transforme les souris en chats par contact. Sauf que le chat reste chat et que les souris n'ont pas de refuge.

https://www.sciencesetavenir.fr/sante/le-coronavirus-mis-a-l-epreuve-combien-de-temps-survit-il-sur-differentes-surfaces_141386

https://www.lemonde.fr/international/article/2020/02/10/la-chine-fait-taire-ceux-qui-veulent-enqueter-sur-le-coronavirus_6029080_3210.html

Donc cette épidémie disparaitra avec le retour de l'été ???

Pourtant dans le corps il fait plus de 30 degrés et le virus persiste.
Qu'est-ce qui fait qu'il aime ce corps chaud alors qu'il préfère l'air frais ?

A méditer.. https://www.sciencesetavenir.fr/sante/epidemie-de-coronavirus-l-opinion-publique-chinoise-affolee-s-en-prend-a-des-scientifiques_141309

siamois93 a écrit:Donc cette épidémie disparaitra avec le retour de l'été ???

Qui arrivera plus tôt et sera plus chaud qu'il ne devrait ! Le réchauffement climatique sauverait des vies, pour une fois. On continue dans l'ironie !

https://www.lepoint.fr/sante/coronavirus-l-epidemie-pourrait-toucher-60-de-la-population-mondiale-11-02-2020-2362070_40.php

Je ne sais pas quelle est la légitimité de Leung ?

Son discours ultra alarmiste est très atypique.
Difficile de savoir quels sont les sous-tendus politiques derrière, Hong Kong est dans une situation très particulières etc.

https://en.wikipedia.org/wiki/Gabriel_Leung

https://sph.hku.hk/en/about-us/faculty-and-staff/academic-staff/leung,-gabriel-m

Peut-être qu'il permet à la Chine, via HK, d'avoir un discours que le parti communiste ne peut politiquement pas se permettre d'avoir ouvertement.

Ou peut-être qu'il dit juste ce qu'il pense parce qu'il est encore intouchable à HK (et conseiller à l'OMS) et qu'il s'en fout de se faire des ennemis au parti.

ne dites plus 2019-nCoV mais  “Covid-19”

" 'CO' will stand for Corona, 'VI' for virus, and 'D' for disease. '19' is for the year the virus immerged.

https://www.7sur7.be/monde/l-oms-nomme-le-nouveau-coronavirus-covid-19~ae4ba7fd/

L'ovni tender a écrit:ne dites plus 2019-nCoV mais  “Covid-19”
https://www.7sur7.be/monde/l-oms-nomme-le-nouveau-coronavirus-covid-19~ae4ba7fd/

David ? hum ça risque de déplaire...

izo a écrit:

L'ovni tender a écrit:ne dites plus 2019-nCoV mais  “Covid-19”
https://www.7sur7.be/monde/l-oms-nomme-le-nouveau-coronavirus-covid-19~ae4ba7fd/

David ? hum ça risque de déplaire...

Tonton David tu veux dire ?

siamois93 a écrit:

izo a écrit:

L'ovni tender a écrit:ne dites plus 2019-nCoV mais  “Covid-19”
https://www.7sur7.be/monde/l-oms-nomme-le-nouveau-coronavirus-covid-19~ae4ba7fd/

David ? hum ça risque de déplaire...

Tonton David tu veux dire ?

bien sur qui d'autre ?

cyranolecho a écrit:Contamines... le hasard a de l'humour parfois.

Et faire du dépistage dans une station de ski ?

Ce que je savais déjà :

[The higher case fatality rate reported from Wuhan may be overestimated. The true number of exposed cases affected in Wuhan may be vastly underestimated. With a focus on thousands of serious cases, mild or asymptomatic courses that possibly account for the bulk of the 2019-nCoV infections might remain largely unrecognized, in particular during the influenza season. Under-detection of mild or asymptomatic cases may be further fueled after further growth of the outbreak, as healthcare-facilities and testing capacities in Wuhan have reached their limits.]

7/02/2020 : https://smw.ch/article/doi/smw.2020.20203

[quote=]"Siamois"Donc cette épidémie disparaitra avec le retour de l'été ???
Pourtant dans le corps il fait plus de 30 degrés et le virus persiste.
Qu'est-ce qui fait qu'il aime ce corps chaud alors qu'il préfère l'air frais ?[/quote]

Ce virus n'aime pas les milieux secs : dans le chaud et l'humide, il est aux anges! C'est pour cela qu'on commence même à penser qu'il peut se transmettre par voie fécale (sans donner de symptômes digestifs). Il colonise les voies humides et chaudes que sont les tractus digestif et respiratoire.

https://www.cnews.fr/monde/2020-02-11/coronavirus-une-epidemie-de-censure-en-chine-926426

https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6

Les cas cliniques ne guérissent pas et ne meurent pas?

contaminés a perpète

???
Non, ils attendent que ça passe en lisant leur horoscope (chinois forcément).

43 146 - 1 018 - 4 347 = 37 781 patients sont en phase symptomatique, pas encore morts ni guéris.

L'ovni tender a écrit:https://www.cnews.fr/monde/2020-02-11/coronavirus-une-epidemie-de-censure-en-chine-926426

Ils ont raison de censurer. Les infos relayées sont soit fausses, soit sans aucun intérêt. Et n'ont pour but que de faire du buzz.

Il vaut mieux d'expliquer :
- Que les personnes à risque de développer la forme grave mortelle sont celles qui sont déjà malades, les personnes âgées et les immunodéprimés
- Que la mort ne survient pas telle la foudre qui s'abat mais est la suite d'une évolution vers pneumonie aggravée
- Que la moyenne d'âge des cas cliniques est élevée : j'avais lu 59 ans. Les personnes qui ont un système immunitaire correct ne craignent rien si ce n'est une petite grippe
- Que les chiffres avancés ne valent pas grand chose pour le moment
- Que ce n'est pas la première pandémie et que ce ne sera pas la dernière. La pandémie se définit par une épidémie qui s'étend à toute la population d'un continent, voire au monde entier. La pandémie la plus dévastatrice fut la grippe espagnole entre 1918 et 1920. À l'heure actuelle, on peut considérer que le Sida, le virus Ebola et la grippe aviaire sont des infections virales pandémiques. Une pandémie survient lorsqu'un nouveau virus fait son apparition, car la population n'est pas immunisée contre ce dernier. Les premiers hôtes de ces nouveaux virus sont les animaux, puis ils finissent par se transmettre à l'homme.

Mais les merdias ne sont pas scientifiques, ils y connaissent walou.

Au printemps 2020, ça sera déjà retombé comme un soufflé. Puis on incitera les personnes à risque à la vaccination pour l'automne prochain.

My-illusion, fais gaffe de ne pas te prendre une claque lorsque le soufflet retombera !

Mais les merdias ne sont pas scientifiques, ils y connaissent walou.

Alors pourquoi relayer ce que tu lis n'importe où ?


Ce virus n'aime pas les milieux secs : dans le chaud et l'humide, il est aux anges!

On ne sait pas encore pour le virus qui nous intéresse ici.


Une étude faite sur un autre corona virus précise un détail croustillant :

Time related inactivation of pathogenic strain of MERS-CoV in airborne form at various climatic conditions has been investigated. It was found the at the temperature of 25 °C the virus demonstrated relatively high, compared to influenza strains, survival with more than 63% live particles remaining in the air 60 min after aerosolisation. The inactivation at the temperature of 38 °C was fortunately much more efficient with only 4.7% active virus detected on completion of 60 min run. Such results demonstrate that even at hot and dry climatic conditions relevant to the Middle Eastern region where this virus was originated from, the strain is able to survive for quite long time periods and could potentially spread resulting from respiratory transmission.
[Conclusions de Survival of aerosolized coronavirus in the ambient air]


Pour des info scientifiques :

Elsevier’s Novel Coronavirus Information Center

Autre extrait d'un article, cette fois sur Covid-19, datant un peu malheureusement (du 5.02.2020, bientôt une petite semaine donc).

From genetic sequencing data, it appears that there was a single introduction into humans followed by human-to-human spread. This novel virus shares 79.5% of genetic sequence with SARS-CoV and has 96.2% homology to a bat coronavirus. In addition, 2019-nCoV shares the same cell entry receptor, ACE2, with SARS-CoV. What is yet unclear is which animal is the intermediate species between bats and humans. For SARS it was civet cats, for MERS it is camels. While the source of 2019-CoV is yet unknown, early on the Huanan Seafood Wholesale Market was linked epidemiologically.

The incubation period of this virus has been reported to be 5.2 days (95% CI, 4.1-7.0),6 although there is suggestion that it may be as long as 14 days. It is unclear when transmission begins and, although cases have been reported that suggest transmission during the asymptomatic phase, it is likely that the majority of secondary cases come from symptomatic individuals.

The clinical syndrome is nonspecific and characterized by fever and dry cough in the majority of patients, with about a third experiencing shortness of breath. Some patients have other symptoms such as myalgias, headache, sore throat, and diarrhea. The median age of patients is between 49 and 56 years. Cases in children have been rare. Although most cases appear to be mild, all patients admitted to the hospital have pneumonia with infiltrates on chest x-ray and ground glass opacities on chest computed tomography. About a third of patients subsequently developed acute respiratory distress syndrome and required care in the intensive care unit. This is particularly true for patients with comorbid conditions such as diabetes or hypertension.

2020 2019 Novel Coronavirus—Important Information for Clinicians

Qu’est ce que je relaie de n’importe où? Je ne mets aucun lien « putaclic »

Si ce virus est un coronavirus, c’est qu’il appartient à sa famille, t’es ok? Tu connais les caractéristiques des coronaviridae?

Rendez-vous dans qqes mois.

Qu’est ce que je relaie de n’importe où? Je ne mets aucun lien « putaclic »

C'est juste, tu relaies n'importe quoi n'importe comment sans citer tes sources.
:respect:

Tu connais les caractéristiques des coronaviridae?

Mieux que toi, manifestement.