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Message par Topsy Turvy Jeu 19 Mar 2020 - 18:08

Hello again,

J'ouvre un fil de présentations et discussions sur la recherche liée à SARS-CoV-2 et covid-19.
Eventuellement aussi sur des articles de vulgarisation par des correspondants spécialisés.

S'il vous plaît, ne pas trop y mêler les articles de presse non spécialisée. Et rien de sources obscures.
Si article de presse, alors plutôt dans l'idée de confronter les propos scientifiques et vulgarisés, please.

Avant de passer aux articles de recherche, quelques liens vers des resources :

LitCovid
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/coronavirus/
Elsevier
https://www.elsevier.com/connect/coronavirus-information-center
Lancet
https://www.thelancet.com/coronavirus
Cell hub
https://www.cell.com/2019-nCOV
Springer Nature hub
https://www.springernature.com/gp/researchers/campaigns/coronavirus
Wiley hub
https://novel-coronavirus.onlinelibrary.wiley.com
New England Journal of Medicine
https://www.nejm.org/coronavirus
British Journal of Medicine
https://www.bmj.com/coronavirus
American Society for Microbiology
https://asm.org/Press-Releases/2020/COVID-19-Resources
1foldr
https://coronavirus.1science.com/search
ScienceDirect
https://www.sciencedirect.com/search/advanced?qs=%22COVID-19%22%20OR%20Coronavirus%20OR%20%22Corona%20virus%22%20OR%20%222019-nCoV%22%20OR%20%22SARS-CoV%22%20OR%20%22MERS-CoV%22%20OR%20“Severe%20Acute%20Respiratory%20Syndrome”%20OR%20“Middle%20East%20Respiratory%20Syndrome”&show=100&ent=true


Et aussi COVID-19 SARS-CoV-2 preprints from medRxiv and bioRxiv
https://connect.medrxiv.org/relate/content/181


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Message par Topsy Turvy Ven 20 Mar 2020 - 9:33

Autre lien que j'aime bien, à consulter régulièrement, pour le suivi à la trace du virus :

Real-time tracking of pathogen evolution
Nextstrain is an open-source project to harness the scientific and public health potential of pathogen genome data. We provide a continually-updated view of publicly available data alongside powerful analytic and visualization tools for use by the community. Our goal is to aid epidemiological understanding and improve outbreak response.

Suivi en temps réel de l'évolution des agents pathogènes
Nextstrain est un projet open source visant à exploiter le potentiel scientifique et de santé publique des données du génome des agents pathogènes. Nous fournissons une vue constamment mise à jour des données accessibles au public ainsi que de puissants outils d'analyse et de visualisation à l'usage de la communauté. Notre objectif est d'aider à la compréhension épidémiologique et d'améliorer la réponse aux flambées.


Nextstrain
Visuel et interactif, pas besoin de maîtriser l'anglais pour utiliser le bidule.

Latest data and analysis
Dernières données et analyses
Faire varier les paramètres à gauche, survoler les visuels à droite
https://nextstrain.org/ncov

En plusieurs langues, ici le premier rapport en français :
Analyse génomique de la propagation du SARS-Cov-2
rapport de situation 2020-03-13
https://nextstrain.org/narratives/ncov/sit-rep/fr/2020-03-13
Pages à faire défiler par sommaire à gauche,
très intéressant, interactif (survoler les visuels).
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Message par Topsy Turvy Ven 20 Mar 2020 - 10:21

Je vais balancer au début de ce fil des papiers dont j'ai déjà parlé mais qui se sont perdus dans f(x). Mais je ne vais pas tous les proposer à nouveau et je vais proposer par contre des compléments pour enrichir et mettre en lumière les évolutions.

Pour plus de clarté des messages, je ne vais pas présenter les reprises en citations.

Je précise avant d'aller plus loin qu'il est exceptionnel d'avoir un tel accès à la recherche en cours, que pour aller vite des études sont proposées à la lecture avant la validation par les pairs, et donc qu'il ne faut pas s'exciter sur le fait qu'une étude soit validée ou pas.

Il arrive qu'une publication soit retirée avec indication des raisons.
Il arrive qu'une publication fasse l'objet de compléments et rectificatifs légers.
Je n'ai pas encore vu beaucoup de retraits et erreurs dans les revues officielles.
(Un retrait de lettre dans The Lancet, mais je peux avoir raté des trucs.)

A l'exception des mises à jour pour le message NextStrain par exemple, je ne reviens pas en arrière pour compléter du contenu, sauf si des informations sont à démentir et que je retrouve où l'indiquer.

Encore une précision :
un papier "recherche", "lettre", etc., ce n'est pas la même chose.
J'essaie de préciser ce qu'il en est, parfois j'oublie de copier l'info.


Dernière édition par Topsy Turvy le Ven 20 Mar 2020 - 14:36, édité 1 fois
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Message par Topsy Turvy Ven 20 Mar 2020 - 10:25

On va commencer par la chloroquine, puisque ça fascine beaucoup de monde.

Pour les curieux comme moi, je propose ce vieil article relativement didactique.
Je précise bien : relativement. Ça reste The Lancet, mais il y a de jolis dessins.
Effects of chloroquine on viral infections: an old drug against today's diseases
Savarino A, Boelaert JR, Cassone A, Majori G, Cauda R.
Lancet Infect Dis. 2003; 3:722-727
https://doi.org/10.1016/S1473-3099(03)00806-5

Rappel d'un message que j'ai mis à plusieurs reprises :
Les rares publications scientifiques sur le sujet de la chloroquine dans le cas de covid-19 sont, pour l’instant [ça peut bouger très vite, je tiendrai au courant], issues du premier pays touché chronologiquement par le virus : la Chine. Un premier article publié le 25 janvier dans la revue Cell Research fait état d’une grande efficacité in vitro de la chloroquine sur ces virus. Rapidement, des essais cliniques ont été lancés en Chine et des résultats préliminaires positifs portant sur une centaine de malades ont été annoncés lors d’un talk de point de situation le 15 février, puis repris le 19 février dans une lettre au journal spécialisé BioScience Trends, sans données chiffrées.

Les liens vers ces papiers, pour ceux que ça intéresse.

L'expérience qui teste plein de trucs in vitro
https://www.nature.com/articles/s41422-020-0282-0

La lettre qui raconte qu'un essai a été fait sur 100 patients sur la base d'un point de situation (un talk)
https://www.jstage.jst.go.jp/article/bst/advpub/0/advpub_2020.01047/_pdf/-char/en

L'article du type de Marseille sur la base de la lettre qui rapporte des infos sur la base d'un point de situation (un talk)
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0924857920300662?via%3Dihub

Le prétendu nouvel article très récent (publié le 16 mars 2020), c'est la lettre déjà mentionnée (voir ci-dessus), puisque en ligne depuis un moment :
Breakthrough: Chloroquine phosphate has shown apparent efficacy in treatment of COVID-19 associated pneumonia in clinical studies
Jianjun Gao, Zhenxue Tian, Xu Yang
Biosci Trends, 14 (1), 72-73
2020 Mar 16
(lettre)
https://doi.org/10.5582/bst.2020.01047
Résumé
Le virus de la maladie des coronavirus 2019 (COVID-19) se propage rapidement, et les scientifiques s'efforcent de découvrir des médicaments pour son traitement efficace en Chine. Le phosphate de chloroquine, un ancien médicament pour le traitement du paludisme, a démontré une efficacité apparente et une innocuité acceptable contre la pneumonie associée au COVID-19 dans des essais cliniques multicentriques menés en Chine. Il est recommandé d'inclure le médicament dans la prochaine version des Lignes directrices pour la prévention, le diagnostic et le traitement de la pneumonie causée par COVID-19 publiées par la Commission nationale de la santé de la République populaire de Chine pour le traitement de l'infection à COVID-19 dans les grandes populations futures.

Plus récemment, un article critique dans la presse scientifique :
Of Chloroquine and COVID-19
Franck Touret, Xavier de Lamballerie
Antiviral Res, 177, 104762
2020 Mar 5 [Online ahead of print]
https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2020.104762
Résumé
Des publications récentes ont attiré l'attention sur les avantages possibles de la chloroquine, un antipaludéen largement utilisé, dans le traitement des patients infectés par le nouveau coronavirus émergé (SRAS-CoV-2). La communauté scientifique devrait considérer ces informations à la lumière des expériences précédentes avec la chloroquine dans le domaine de la recherche antivirale.

Highlights

Les données in vitro suggèrent que la chloroquine inhibe la réplication du SRAS Cov-2.

Dans des recherches antérieures, la chloroquine a montré une activité in vitro contre de nombreux virus différents, mais aucun avantage dans les modèles animaux.

La chloroquine a été proposée à plusieurs reprises pour le traitement des maladies virales aiguës chez l'homme sans succès.

Les résultats de certains essais cliniques en cours sur la chloroquine en Chine ont été annoncés, sans accès aux données.

L'examen par les pairs des résultats et une évaluation indépendante des avantages potentiels pour les patients sont essentiels.

A suivre pour la chloroquine, mais ce ne sera pas dans ce message, ce sera quelque part dans la suite du fil.
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Message par Topsy Turvy Ven 20 Mar 2020 - 11:25

Au sujet des "petits patients" de covid-19 (pourquoi en petit nombre, particularités cliniques,...)

Are children less susceptible to COVID-19?
Ping-Ing Lee, Ya-Li Hu, Po-Yen Chen, Yhu-Chering Huang & Po-Ren Hsueh
Journal of Microbiology, Immunology, and Infection
Available online 25 February 2020
In Press, Journal Pre-proof
https://doi.org/10.1016/j.jmii.2020.02.011
Les enfants sont-ils moins sensibles au COVID-19?
Traduction :

2019-nCoV: Polite with children!
Caselli D, Aricò M.
Pediatr Rep. 2020 Feb 11;12(1):8495
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7036705/
2019-nCoV: poli avec les enfants!
Extrait:

Clinical and CT Features in Pediatric Patients With COVID-19 Infection: Different Points From Adults
Xia, W, Shao, J, Guo, Y, Peng, X, Li, Z, Hu, D.
Pediatric Pulmonology. 2020; 1– 6.
(recherche clinique)
https://doi.org/10.1002/ppul.24718
Caractéristiques cliniques et tomodensitométriques chez les patients pédiatriques infectés par COVID-19: différents points par rapport aux adultes
Résumé:
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Message par Topsy Turvy Ven 20 Mar 2020 - 11:51

Je ne mets qu'un article sur ce message, celui sur lequel tout le monde s'est beaucoup basé longtemps. C'était le premier point de situation sur une grande cohorte de patients en Chine : les 70'000 premiers patients, dont les dossiers ont été étudiés pour divers facteurs (d'où les observations en fonction du sexe, de l'âge, des antécédents,...).

The Epidemiological Characteristics of an Outbreak of 2019 Novel Coronavirus Diseases (COVID-19) — China, 2020[J]
The Novel Coronavirus Pneumonia Emergency Response Epidemiology Team
China CDC Weekly, 2020, 2[8]: 113-122.
http://weekly.chinacdc.cn/en/article/id/e53946e2-c6c4-41e9-9a9b-fea8db1a8f51
Résumé:
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Message par Topsy Turvy Ven 20 Mar 2020 - 11:54

Encore un message court pour un sujet particulier.
J'ai hésité à en parler juste après NextStrain, j'aurais dû.

Rappel :

Je vous propose de jouer avec GISAID
(Global Initiative on Sharing All Influenza Data)
Genomic epidemiology of SARS-CoV2.

On peut jouer avec l'épidémiologie génomique.
(Et choisir la grippe ou l'ébola si on préfère.)
N'hésitez pas à ouvrir le panneau de gauche.

Enjoy !
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Message par Topsy Turvy Ven 20 Mar 2020 - 12:04

Rappel au sujet des femmes (et enfants pour le premier), questions de sexe et de genre :

Coronavirus: Are women and children less affected?
By James Gallagher
Health and science correspondent
https://www.bbc.com/news/health-51774777
Coronavirus: les femmes et les enfants sont-ils moins touchés?
Traduction :

COVID-19: the gendered impacts of the outbreak
Clare Wenham, Julia Smith, Rosemary Morgan
(on behalf of the Gender and COVID-19 Working Group)
The Lancet
[Comment]
Published: March 6, 2020
https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30526-2
COVID-19: les impacts genrés de l'épidémie
Extraits:
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Message par Pieyre Ven 20 Mar 2020 - 14:14

Je constate que tu as supprimé les références aux cartes de ton premier message. C'est très bien, au fond : cela me permet de revenir sur mes réticences; aussi je vais ouvrir un sujet spécifique à la cartographie du covid-19.

Mais il faudra m'aider en indiquant des liens utiles. J'ai déjà ouvert un sujet sur la cartographie; c'était sur le plan politique; mais je ne l'ai pas suivi (il faudrait d'ailleurs que je m'y remette). Il ne s'agira pas de débattre – même si on le pourra aussi – mais surtout de contribuer.

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Message par Topsy Turvy Ven 20 Mar 2020 - 14:41

Merci Pieyre, je te laisse reprendre ce que tu peux de ce message dans f(x) :
https://www.zebrascrossing.net/t39751p300-fx-coronavirus-covid-19#1687439
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Message par Topsy Turvy Ven 20 Mar 2020 - 15:12

Au sujet de la chloroquine, une équipe catalane explique les raisons et les conditions d'une étude qu'ils vont mener sur leurs prochains cas déclarés et les contacts de ceux-ci :

Use of antiviral drugs to reduce COVID-19 transmission
Mitjà, Oriol et al.
The Lancet Global Health
Online first
Published:March 19, 2020
https://doi.org/10.1016/S2214-109X(20)30114-5
Utilisation de médicaments antiviraux pour réduire la transmission du COVID-19
Traduction :

Ils donnent les référence NIH des tests cliniques :
Chine (Shanghai) : hydroxychloroquine, 30 sujets, random, pas aveugle, dès 06.02.2020, en phase 3
https://www.clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04261517
Corée (Séoul) : Lopinavir/Ritonavir ou Hydroxychloroquine, 150 sujets, random, pas aveugle, dès 11.03.2020, en phase 2
https://www.clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04307693
Espagne (divers) : chloroquine, 3'040 sujets, random, pas aveugle, dès que possible (mars 2020?), pas encore de recrutement
https://www.clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04304053

En ce moment, une grosse centaine d'essais cliniques sur covid-19 enregistrés au NIH :
https://www.clinicaltrials.gov/ct2/results?cond=covid-19


Dernière édition par Topsy Turvy le Ven 20 Mar 2020 - 16:37, édité 1 fois
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Message par paela Ven 20 Mar 2020 - 15:50

Je sers une tournée concernant l'évaluation du nombre de personnes contaminées par le Sars-CoV-2.
Je fais aussi quelques commentaires.

Termes et acronymes fréquemment utilisés.:

Commentaire général et "Underascertainment rate":

Important:

1) The Rate of Underascertainment of Novel Coronavirus (2019-nCoV) Infection: Estimation Using Japanese Passengers Data on Evacuation Flights, 3 février 2020
Journal of Clinical Medecine
https://www.mdpi.com/2077-0383/9/2/419/htm
objectifs:
résultats:

2) Estimates of the severity of the Covid-19 disease, 13 mars 2020
(prépublication)
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.09.20033357v1
objectifs:
résultats:
résultats par tranche d'âge:

3) Impact of non-pharmaceutical interventions (NPIs) to reduce COVID-19 mortality and healthcare demand, 16 mars 2020 (prépublication)
https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/sph/ide/gida-fellowships/Imperial-College-COVID19-NPI-modelling-16-03-2020.pdf
objectifs:
Quelques mots sur la méthode:
IFR:
modélisation:
portée de la modélisation:
effet des mesures en graphique:

A mon sens, ce petit échantillon montre que même en supposant que les données sont fiables et même en se basant sur des échantillons proches, on ne sait pas grand chose de ce coefficient C qui est aussi probablement très variable. Je suis en fait plus convaincu par la méthode qui consiste à regarder les rapports R_m(t') / R_m(t) où t'-t correspond à la durée entre l'apparition des symptômes et le test, pour fournir une minoration en ordre de grandeur de C.

éditable: Topsy Turvy, souhaiterais-tu qu'il y ait des discussions au sujet de ces articles, par exemple des explications? Si oui, quand et comment?


Dernière édition par paela le Sam 21 Mar 2020 - 10:42, édité 1 fois
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Message par Topsy Turvy Ven 20 Mar 2020 - 16:48

Rigolo, le 16, j'avais mis de côté ton dernier article proposé ci-dessus pour en parler.
Mais tout à l'heure j'ai balancé le truc à la corbeille en me disant que c'était obsolète.
En effet, je pense que c'est le genre d'études qui visait à renseigner les dirigeants.
Du coup, c'est sympa que tu en parles en précisant de quoi il retourne et le rôle probable.

Merci paela !

Pour l'instant, je n'ai pas l'impression que beaucoup de gens aient envie de causer de ça.
Mais j'imagine que sur ce fil ça pourrait le faire, même à la manière zc, un peu bordélique.
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Message par Topsy Turvy Sam 21 Mar 2020 - 10:25

COVID-19 Kit de survie pour s’y retrouver : symptômes, tests, traitements et dynamique de l’épidémie

Quoi dans mon assiette
Actualités en sciences, alimentation et santé – Uniquement basé sur des publications
scientifiques !

SYNTHESE de la littérature scientifique sur le SRAS-CoV-2
par Thibault FIOLET (Ingénieur AgroParisTech, Doctorant à l’Université Paris-Saclay en Santé Publique)


Stegos a écrit:Simple, et bien fait.. [...]

https://quoidansmonassiette.fr/covid-19-analyse-synthese-informations-fiables-symptome-dynamique-epidemie-traitement/

A consulter !

Merci Stegos.
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Message par Topsy Turvy Sam 21 Mar 2020 - 12:53

Le première étude au sujet de la persistance du virus sur différents supports :

Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1
van Doremalen N, Bushmaker T, Morris DH, et al.
N Engl J Med. 2020;10.1056/NEJMc2004973.
[published online ahead of print, 2020 Mar 17]
(correspondance)
doi:10.1056/NEJMc2004973

Stabilité des aérosols et de la surface du SARS-CoV-2 par rapport au SARS-CoV-1
Extrait
Nos données couvrent 10 conditions expérimentales impliquant deux virus (SARS-CoV-2 et SARS-CoV-1) dans cinq conditions environnementales (aérosols, plastique, acier inoxydable, cuivre et carton). Toutes les mesures expérimentales sont rapportées comme moyennes sur trois répétitions.
Article
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2004973?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%20%200pubmed

Figure (interprétable sans traduction )
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2004973?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%20%200pubmed
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Message par Topsy Turvy Dim 22 Mar 2020 - 15:58

The Lancet propose régulièrement des éditoriaux intéressants.

J'en propose à nouveau un, publié hier.

Rappel :
Sauf erreur, la France a perdu aujourd'hui son premier médecin atteint de covid-19.
L'Indonésie, qui compte ~50 décès de covid-19, a perdu trois médecins ce week-end.
En Italie, 20% des agents de la santé au front ont été contaminés, certains sont décédés.

COVID-19: protecting health-care workers
The Lancet,
The Lancet, Volume 395, Issue 10228, 922
(Editorial)
https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30644-9
COVID-19: protéger les travailleurs de la santé
Traduction soignée et mise en gras d'extraits:
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Message par Topsy Turvy Dim 22 Mar 2020 - 16:39

Un message au sujet de l'olfaction et du goût. L'altération de ces sens semble être un des symptômes de SARS-CoV-2, même dans des cas autrement considérés sans symptômes.

La presse a relayé des observations faites par des spécialistes en ORL dans différents pays comme la Chine, L'Iran, l'Angleterre, l'Italie, etc.

Pour l'instant, je ne trouve pas de papier dans les revues scientifiques au sujet de l'impact de SARS-CoV-2 sur l'olfaction et le goût. Mais je propose deux références anciennes pour un aperçu de liens entre pathogènes et anosmie.

Identification of Viruses in Patients With Postviral Olfactory Dysfunction
Suzuki M, Saito K, Min WP, et al.
Laryngoscope. 2007;117(2):272–277
https://doi.org/10.1097/01.mlg.0000249922.37381.1e
Identification de virus chez les patients atteints de dysfonctionnement olfactif postviral
Résumé:

Handbook of Clinical Neurology : chapter 21 systemic diseases and disorders
Doty RL
Handb Clin Neurol. 2019;164:361–387
(chapitre de textbook, accès payant)
https://doi.org/10.1016/B978-0-444-63855-7.00021-6
Chapitre 21 - Maladies et troubles systémiques
Résumé :
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Message par Topsy Turvy Dim 22 Mar 2020 - 16:52

Remdesivir
A mesure que SARS-CoV-2 et civid-19 se propagent, un médicament qui suscitait autrefois les espoirs du monde entier se voit offert une nouvelle vie

Je remets ce message ici :

J’ai lu un article très chouette qui raconte l’histoire du remdesivir. De la molécule 3a initialement créée en labo aux espoirs actuels dans le traitement de covid-19.

Ça raconte le parcours du combattant de ce traitement, qui était initialement prévu pour servir d'arme thérapeutique dans le cas d’Ebola. Après toutes les péripéties des tests in vitro, puis in vivo, ainsi que les demandes d'autorisation, etc., le résultat n'a malheureusement pas été convaincant pour Ebola.

A présent, il y a de l’espoir (espoir, donc ça reste à vérifier) pour SARS-CoV-2. Ce virus est très différent du virus Eboa, mais la structure sur laquelle le médicament agit en est assez proche. Il s’agit d’introduire comme des pièces défectueuses dans le processus de copie de l’information du virus pour que celui-ci ne puisse plus parvenir à ses fins : se répliquer.

C’est très sympa à lire, mais en anglais (et trop long pour que je me colle à lancer une traduction).

SPECIAL REPORT
As the coronavirus spreads, a drug that once raised the world’s hopes is given a second shot
By ANDREW JOSEPH @DrewQJoseph
https://www.statnews.com/2020/03/16/remdesivir-surges-ahead-against-coronavirus/
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Message par RonaldMcDonald Dim 22 Mar 2020 - 17:03

de toutes façons, vu ou on en est, on teste tout, et on voit ce qui marche.
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Message par Topsy Turvy Dim 22 Mar 2020 - 17:13

Euh... merci pour ta contribution... (?)
Cela dit, mon dernier message propose quand même un article qui me paraît très intéressant.
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Message par Topsy Turvy Dim 22 Mar 2020 - 18:40

Au sujet des vaccins, cela fait un moment que je veux parler de cet article.
Et j'ai beaucoup repoussé son traitement en espérant pouvoir faire ça bien.

Finalement, je propose de lire l'article original (avant peer-review) si on parle anglais.
Ou, sinon, de lire la traduction d'un chapitre, qui parle des recherches de vaccins contre les betacoronarirus.

Rappel : dans le groupe des coronavirus auquel appartient SARS-CoV-2, on connaît déjà chez l’homme quatre virus qui sont responsables de simples rhumes et deux autres virus moins anecdotiques : SARS (version 1) et MERS (ces deux étant des betacoronavirus, comme SARS-CoV-2).

On n’a jamais pu bénéficier du moindre vaccin pour un de ces virus.
Jamais.
Aucun.

La recherche de vaccins pour SARS-CoV-2 se fait, mais il vaut la peine de regarder d’où on vient.

SARS-CoV-2 vaccines: status report
Amanat and Krammer
Immunity
CellPress
Journal pre-proof
(Perspective)
https://marlin-prod.literatumonline.com/pb-assets/journals/research/immunity/SARS-CoV-2%20vaccines%20status%20report.pdf

Que savons-nous de la conception de vaccins contre les betacoronavirus?
Traduction soignée d'un chapitre, en guise d'aperçu :
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Message par Topsy Turvy Lun 23 Mar 2020 - 19:32

Pas un papier, mais ce serait dommage que ça se perde sur le forum.

Je conseille de regarder (ou écouter) la conférence et /ou de regarder le diaporama !
https://www.college-de-france.fr/media/philippe-sansonetti/UPL1414529259917354829_Covid_19_Sansonetti.pdf

Covid-19 ou la chronique d'une émergence annoncée


https://www.youtube.com/watch?v=JKY1i7IpK3Y
(Collège de France)

Web conférence du Pr Philippe Sansonetti, prononcée le 16 mars 2020.

Télécharger le support de la conférence :
https://www.college-de-france.fr/site/philippe-sansonetti/seminar-2020-03-16-13h00.htm

Philippe Sansonetti est professeur titulaire de la chaire Microbiologie et maladies infectieuses.
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Message par 404 Mar 24 Mar 2020 - 14:48

Concernant l'étude marseillaise de la chloroquine, le lien vers la revue (publique) par les pairs avant publication. Vous avez le lien vers l'étude, les critiques formulées par les pair de manière publique, les questions posées à l'équipe.

https://pubpeer.com/publications/B4044A446F35DF81789F6F20F8E0EE?fbclid=IwAR1IKJqKf-A0_cszBv0KP7CPYb7L5G6-kyxKOgF53K2iCALF245EbKwabpQ

Pour ceux qui voudraient une version française synthétique des différentes critiques formulées vis à vis de l'étude (pas du traitement lui-même ou de la chloroquine, ce qui est bien différent, simplement de l'étude et des résultats) :
https://twitter.com/ColinGiacobi/status/1241720022789210112
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Message par Topsy Turvy Ven 27 Mar 2020 - 10:54

The Global Impact of COVID-19 and Strategies for Mitigation and Suppression
COVID-19 reports - Report 12 - 26 March 2020
MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis - Imperial College London‌

Extrait d'article BBC News qui parle de ce rapport
Analyse de David Shukman, rédacteur scientifique

Derrière la formulation prudente et le langage froid de cette étude se cache une vision cauchemardesque de ce que la pandémie pourrait signifier à l'échelle mondiale, en particulier pour les personnes les plus pauvres de la planète.

Avec des ménages plus grands, comprenant les générations plus âgées les plus à risque, et des systèmes de santé beaucoup plus fragiles que ceux des pays riches, les perspectives pour les pays en développement semblent sombres.

S'adressant aux scientifiques pendant qu'ils préparaient le rapport, il était clair qu'ils n'étaient que trop conscients des horribles implications de leur travail.

À l'origine, l'étude devait être publiée la semaine dernière, mais au fil des jours, de nouvelles données ont émergé qui pourraient être ajoutées au modèle - la simulation informatique de l'épidémie - pour le rendre plus précis.

Tout cela mène à une conclusion brutale: à mesure que le virus se propage, seules les mesures les plus draconiennes atténueront l'impact et que les pays les moins capables de se protéger seront parmi les plus durement touchés.
https://www.bbc.com/news/health-52055546

Page de résumé et lien vers le PDF complet :
https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/news--wuhan-coronavirus/

Lien direct vers le PDF complet :
https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/sph/ide/gida-fellowships/Imperial-College-COVID19-Global-Impact-26-03-2020.pdf

Résumé d'article en traduction rapide:
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Message par Topsy Turvy Ven 27 Mar 2020 - 15:58

Au sujet des enfants, à nouveau
C'est étrange, je pensais avoir déjà parlé de ce papier, mais il ne figure pas sur ce fil.
Peut-être que c'est un article dont j'ai parlé sur f(x) et que j'ai oublié de basculer ici.
Même si la date de parution annoncée est récente, je l'ai lu il y a longtemps. Whatever.


Why is COVID‐19 so mild in children?
Petter Brodin
Acta Pædiatrica
First published: 25 March 2020
EDITORIAL  Free Access
https://doi.org/10.1111/apa.15271
This article has been accepted for publication and undergone full peer review but has not been through the copyediting, typesetting, pagination and proofreading process, which may lead to differences between this version and the Version of Record.

Pourquoi COVID ‐ 19 est-il si doux chez les enfants?
Traduction rapide d'un extrait :
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Message par Topsy Turvy Ven 27 Mar 2020 - 16:18

Au sujet de la lois, aux USA :

Covid-19 — The Law and Limits of Quarantine [US]
Parmet W.E. and Sinha M.S.
Publication: The New England Journal of Medicine
Publisher: Massachusetts Medical Society
Date: Mar 18, 2020
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp2004211

Author affiliations : From the Center for Health Policy and Law, Northeastern University School of Law (W.E.P., M.S.S.), the Harvard–MIT Center for Regulatory Science (M.S.S.), and Harvard Medical School (M.S.S.) — all in Boston.

Je trouve très intéressant de lire des avis de juristes sur les mesures.
Comme il s'agit ici d'une (~courte) perspective US, je ne traduis rien.
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Message par Topsy Turvy Ven 27 Mar 2020 - 16:47

Pas un papier de recherche académique, mais un exposé de notions que je trouve intéressant, au sujet des assurances.

COVID-19: A Forensic Accountant’s Perspective on How Coverage Issues Could Impact Quantification
https://www.mdd.com/forensic-accounting-articles/covid-19-a-forensic-accountants-perspective-on-how-coverage-issues-could-impact-quantification/

COVID-19: Point de vue d'un juricomptable sur la façon dont les problèmes de couverture pourraient influer sur la quantification
Traduction de la conclusion:
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Message par Topsy Turvy Sam 28 Mar 2020 - 9:28

Retour sur du bioméd.
J'ai un peu évité jusque-là de proposer des papiers sur le système immunitaire.
Mais la réponse immunitaire est un facteur clé du déroulement de covid-19.

Là, un résumé d'article CellPress en preprint (PDF complet payant) :

Overly Exuberant Innate Immune Response to SARS-CoV-2 Infection
Zhou Zhou et al.
Cell Host & Microbe
31 Pages
Posted: 24 Mar 2020
Sneak Peek Status: Under Review
http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.3551623

Réponse immunitaire innée trop exubérante due à l'infection par le SRAS-CoV-2
[...] Contrairement au SARS-CoV, qui est réputé induire une réponse insuffisante à l'interféron (INF), le SARS-CoV-2 a déclenché de manière robuste l'expression d'une myriade de gènes stimulés par l'INF (ISG). Ces ISG présentent des potentiels immunopathogènes [...]
Résumé traduit:
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Message par Topsy Turvy Sam 28 Mar 2020 - 9:55

Réponse immunitaire toujours, mais un regard porté ici sur les taux de divers lymphocytes :

ACCEPTED MANUSCRIPT
Dysregulation of immune response in patients with COVID-19 in Wuhan, China
Clinical Infectious Diseases
ciaa248
Published: 12 March 2020
https://doi.org/10.1093/cid/ciaa248

Dysrégulation de la réponse immunitaire chez les patients atteints de COVID-19 à Wuhan, en Chine
Le nouveau coronavirus pourrait principalement agir sur les lymphocytes, en particulier les lymphocytes T.
Résumé traduit:
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Message par Topsy Turvy Sam 28 Mar 2020 - 19:12

Petite parenthèse "data science".

COVID-19 is a Data Science Issue
Patterns
Sarah Callaghan, 25 March 2020
(Opinion)

Quelques extraits traduits:
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Message par Topsy Turvy Mar 31 Mar 2020 - 19:12

Un papier CellPress de témoignages de chercheurs n'ayant rien à voir avec l'épidémie.

I May Not Have Symptoms, but COVID-19 Is a Huge Headache
Cranford
Matter (31.03.2020)
https://doi.org/ 10.1016/j.matt.2020.03.017

Traduction du début (pour donner l'idée):
Je n'ai peut-être pas de symptômes, mais COVID-19 est une énorme prise de tête

La pandémie de COVID-19 a été pour le moins une surprise sans précédent. Le milieu universitaire est enraciné dans des assemblées de groupe - de la salle de classe aux conférences - qui ont été rapidement annulées et / ou déplacées vers des tentatives à distance. Voici quelques points de vue de professeurs impliqués.

Cet article est une expérience de co-dition d'opinion en mode crowd-sourcing, compilée via une invitation ouverte à l'aide de Twitter. Un document Google a été lancé, ouvert au public pour des révisions / modifications, et lié via un tweet du 10 mars au 16 mars 2020 - relativement tôt dans la réponse à la pandémie aux États-Unis. Voici les résultats, avec peu de révision.

[...]
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Message par Topsy Turvy Jeu 2 Avr 2020 - 11:44

SARS-CoV-2 in wastewater: potential health risk, but also data source
Willemijn Lodder, Ana Maria de Roda Husman
The Lancet Gastroenterology & Hepatology
Published: April 1, 2020
(Correspondance)
https://doi.org/10.1016/S2468-1253(20)30087-X

SARS-CoV-2 dans les eaux usées: risque potentiel pour la santé, mais aussi source de données
Traduction du début:
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Message par Topsy Turvy Jeu 2 Avr 2020 - 15:40

Infographic: global research trends in infectious disease
Download Elsevier’s infographic on infectious disease research trends, top research orgs and the impact of outbreaks

Téléchargez l'infographie d'Elsevier sur les tendances de la recherche sur les maladies infectieuses, les principaux organismes de recherche et l'impact des épidémies

https://www.elsevier.com/connect/infographic-global-research-trends-in-infectious-disease

https://www.elsevier.com/__data/assets/pdf_file/0009/992394/Infographic-Infectious-Disease-Outbreaks-Research-Trends.pdf

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Message par siamois93 Ven 3 Avr 2020 - 3:08


https://www.mediterranee-infection.com/procedure-de-securisation-de-la-prescription-du-traitement-hydroxychloroquine-azithromycine/
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Message par siamois93 Ven 3 Avr 2020 - 8:38

https://lphinfo.com/nouvelle-percee-israelienne-dans-la-lutte-contre-le-corona/

Des tests effectués sur un échantillon de personnes ont permis de constater que près de 50% des personnes atteintes du Corona présentent un taux bas d’oxygène
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Message par Topsy Turvy Ven 3 Avr 2020 - 18:37

Je me demandais si faire un résumé ou traduire des bouts.
Mais l'article est protégé et j'ai la flemme de bosser dessus.
Un parallèle proposé avec des situations de transplantés.

Why the immune system fails to mount an adaptive immune response to a Covid ‐19 infection
P. Ahmadpoor  L. Rostaing
Transplant International
First published: 01 April 2020
(letter)
https://doi.org/10.1111/tri.13611

accepted for publication and undergone full peer review
but not been through copyediting, typesetting, pagination and proofreading process


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Message par Topsy Turvy Sam 4 Avr 2020 - 23:05

Rien de surprenant dans le papier qui suit.

Juste que les soins dentaires, là, c'est pas conseillés.
Mais laisser trainer les soucis c'est aussi pas conseillés.
Et on peut préférer retirer une dent plutôt que la réparer.

Il s'agit juste d'une correspondance de dentistes UK.

Urgent dental care for patients during the COVID-19 pandemic
Dave, Manas et al.
The Lancet, Volume 0, Issue 0
Published:April 03, 2020DOI
https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30806-0
(correspondance)

Traduction rapide:
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Message par Topsy Turvy Dim 12 Avr 2020 - 14:08

Hier, The Lancet a publié une flopée de trucs intéressants. J'ai balancé quelques papiers sur d'autres fils, je reviens ici, même si certains papiers pourraient être évoqués ailleurs.

Déjà un extrait qui parle de santé sexuelle et reproductive en lien avec covid-19 (et qui parle de droit, mais je ne traduis qu'un court extrait sans cet aspect.)

Centring sexual and reproductive health and justice in the global COVID-19 response
Kelli Stidham Hall, Goleen Samari, Samantha Garbers, Sara E Casey, Dazon Dixon Diallo, Miriam Orcutt, and others
The Lancet, Vol. 395, No. 10231
Published: April 11, 2020
DOI:https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30801-1

[...]les études à ce jour ont été basées sur des cas du troisième trimestre et les infections virales pendant la grossesse sont généralement les plus graves au cours des 20 premières semaines de gestation.

On s'attend à ce que la perturbation des services et le détournement des ressources des soins de santé sexuelle et reproductive essentiels augmente les risques de morbidité et de mortalité maternelles et infantiles en raison de la priorité accordée à la réponse COVID-19. Globalement, il y a des pénuries de contraception prévues. Les dispensateurs de soins de santé sexuelle et reproductive et les cliniques, qui sont les dispensateurs de soins primaires et le filet de sécurité pour les femmes en âge de procréer, les jeunes, les personnes non assurées pour les soins de santé et les personnes à faible revenu dans de nombreux pays, y compris aux États-Unis, peuvent également être considérés comme non essentiels et détournés pour répondre à COVID-19. Les crises humanitaires passées ont montré que l'accès réduit aux services liés à la planification familiale, à l'avortement, au VIH, à la violence sexiste et la santé mentale entraîne une augmentation des taux et des séquelles des grossesses non désirées, avortements à risque, infections sexuellement transmises (IST), complications de la grossesse, fausse couche, trouble de stress post-traumatique, dépression, suicide, partie intime la violence sexuelle et la mortalité maternelle et infantile. De plus, le racisme systémique, la discrimination et la stigmatisation sont susceptibles de compliquer davantage les obstacles logistiques à l'accès aux soins de santé sexuelle et génésique pour les femmes et les groupes marginalisés.
[...]
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Message par Topsy Turvy Dim 12 Avr 2020 - 14:19

Dans la catégorie impact sur la santé à cause de covid-19 sans qu'il soit directement question de covid-19, un article italien fait froid dans le dos.

On a évoqué que les gens, partout en Europe, ne font plus appel (ou moitié moins qu'avant) aux urgences pour les crises cardiaques, par exemple.

Les urgences ne sont plus assez utilisées (quand elles sont disponibles), et c'est un problème grave, en fait.


Delayed access or provision of care in Italy resulting from fear of COVID-19
Marzia Lazzerini, Egidio Barbi, Andrea Apicella, Federico Marchetti, Fabio Cardinale, Gianluca Trobia
The Lancet Child & Adolescent Health
Published: April 9, 2020
(Correspondance)
https://doi.org/10.1016/S2352-4642(20)30108-5
[...]
Les écoles et les activités sportives sont fermées depuis le 1er mars en Italie, il est donc compréhensible que le nombre d'infections aiguës et de traumatismes chez les enfants soit plus faible que d'habitude. En outre, relativement peu de cas de COVID-19 chez les enfants ont été signalés. [...]

Cependant, les enfants continuent de tomber malades avec des infections et des complications occasionnelles ou l'apparition précoce d'affections chroniques telles que le cancer, les troubles endocriniens (par exemple, le diabète) et les conditions chirurgicales (par exemple, l'appendicite). Les diminutions substantielles de l'accès aux soins pédiatriques en Italie pourraient refléter la rareté des ressources disponibles en raison de la redistribution liée à la pandémie, ou la réticence de la part des parents et des soignants à risque d'exposition au virus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) dans un milieu de soins de santé, en plus de taux plus faibles d'infections aiguës et de traumatismes. Cet accès réduit aux soins de santé peut être préjudiciable à la santé pédiatrique, et les enfants ayant des besoins spéciaux (par exemple, en raison de la paralysie cérébrale, de l'encéphalopathie épileptique, de maladies syndromiques graves ou d'une immunosuppression iatrogène ou liée à la maladie) sont potentiellement plus à risque de maladie grave n'accédant pas aux soins de santé que leurs pairs en bonne santé.
Au sein d'un réseau italien de recherche en hôpital pédiatrique, 12 cas de retard d'accès aux soins hospitaliers ont été signalés au cours de la semaine du 23 au 27 mars dans cinq hôpitaux [...]

Sur cette petite série de 12 cas, la moitié des enfants ont été admis en unité de soins intensifs et quatre sont décédés. Dans tous les cas, les parents ont déclaré éviter d'accéder à l'hôpital par crainte d'une infection par le SRAS-CoV-2. En outre, dans cinq cas, la famille avait contacté les services de santé avant d'avoir accès aux soins, mais son fournisseur de soins de santé n'était pas disponible en raison de l'épidémie de COVID-19, ou l'accès à l'hôpital était découragé en raison du risque possible d'infection. Tous les cas étaient négatifs pour le SRAS-CoV-2 ou avaient une présentation clinique (par exemple, le diabète) qui ne justifiait pas un test de diagnostic selon les critères nationaux. Notamment, aucun décès n'est survenu dans les mêmes hôpitaux au cours de la même période en 2019, et le nombre annuel total de décès pédiatriques dans ces hôpitaux varie de zéro à trois.
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Message par Topsy Turvy Dim 12 Avr 2020 - 14:35

Un papier sur l'impact de la crise et des mesures inadéquates dans les régions les plus vulnérables.

Softening the blow of the pandemic: will the International Monetary Fund and World Bank make things worse?
Alexander Kentikelenis, Daniela Gabor, Isabel Ortiz, Thomas Stubbs, Martin McKee, David Stuckler
The Lancet Global Health
Published: April 9, 2020
(Commentaire)
https://doi.org/10.1016/S2214-109X(20)30135-2
La pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) pousse non seulement les systèmes de santé à leurs limites, mais elle devient rapidement une menace pour l'ensemble de l'économie mondiale, à une échelle beaucoup plus grande que la crise financière de 2007-2008. Les décideurs des pays à revenu élevé n'ont pas tardé à réagir, promettant un soutien sans précédent aux citoyens et aux entreprises. [...]

De telles mesures ne sont toutefois pas ouvertes aux pays à faible revenu et à revenu intermédiaire (PRITI), qui seront les plus touchés par la pression du COVID-19. Les marchés émergents ont été parmi les premiers desquels les investisseurs ont fui et ont jusqu'à présent retiré plus de 83 milliards de dollars de ces marchés, le plus important flux de capitaux jamais enregistré. Cela limite le crédit disponible pour les gouvernements et les entreprises, fait baisser les prix des produits de base et l'activité économique réelle, et finalement réduit les budgets du système de santé à un moment où la capacité doit de toute urgence augmenter.
[...]
Encore une fois, le FMI et certaines parties de la Banque mondiale mènent des politiques qui auront des conséquences néfastes sur les résultats en matière de santé car elles donnent la priorité aux objectifs budgétaires et aux solutions axées sur le marché. Y a-t-il une alternative? Nous prétendons que oui.
[...]
Pendant des décennies, les institutions financières internationales ont poursuivi des politiques qui sapent les systèmes de santé publique, permettant à des milliards de personnes de rester sans soins de santé adéquats. La pandémie de COVID-19 est l'occasion de faire les choses différemment.
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Message par Topsy Turvy Dim 12 Avr 2020 - 16:21

Un papier plus psychologie et évolution, sympa.

Pandemics and the great evolutionary mismatch
Dezecache et al.
Current Biology
(Editorials and opinions)
https://marlin-prod.literatumonline.com/pb-assets/products/coronavirus/Dezecache.pdf

Je ne traduis que quelques extraits, comme d'hab, pour donner une idée :
La crise actuelle de Covid-19 rouvre une partie du questionnement central de la psychologie: comment les humains se comportent-ils en réponse à la menace? Peut-on les inciter à se comporter différemment? Les comportements de panique et égoïstes sont généralement considérés comme les réponses prédominantes au danger perçu. Cependant, les gens s'affilient et recherchent encore plus de contacts sociaux lorsqu'ils sont exposés à une menace. Ces inclinations auraient pu être adaptatives dans notre passé évolutif. Ils sont notre problème le plus grave maintenant.
[...]
Qui est le «nous» dans «nous sommes dans le même bateau»?

Qu'il y ait une menace ne signifie pas qu'elle sera perçue comme telle. Il en va de même pour sa gravité ou la mesure dans laquelle il sera réagi. Les gens peuvent donner de la crédibilité à des sources autres que les sources officielles et sous-estimer la menace, mais ils ne sont pas crédules [18,19], et le danger est susceptible de les rendre encore plus vigilants. Beaucoup d’entre nous croient clairement qu’il existe une menace, mais ne la perçoivent pas comme une menace collective qui affecte directement «nous».

Un problème majeur est que les maladies sont largement invisibles, en particulier les maladies (comme covid-19) qui restent asymptomatiques dans une grande partie de la population. Cette imperceptibilité signifie qu'elle n'est même pas détectée, et encore moins reconnue comme une menace collective. Par conséquent, les mécanismes d'évitement défensifs associés à la peur et au dégoût ne fonctionneront pas. De même, nos tendances sociales se poursuivent simplement car, en l’absence de symptômes, nous ne percevons pas que nous pouvons être porteurs de l’infection. Même si nous pensons que la menace est répandue au sein de notre propre groupe, les implications pour nous-mêmes sont difficiles. Reconnaître que l'on est susceptible de devenir une menace mortelle pour les autres est incongru avec notre image de soi, conduisant à la dissonance et au déni du danger.

Il y a cependant un deuxième problème: une menace provenant d'une infection, dans les sociétés dotées de systèmes de santé fonctionnant de manière optimale, peut être détectée et pourtant reconnue comme grave seulement pour une petite fraction de la population. À moins que nous sentions que nous appartenons à cette fraction, la menace ne peut pas être interprétée comme collective: ce sont eux, pas nous. Une menace qui reste invisible, et qui ne s'appliquerait qu'à certaines personnes, est différente des autres menaces (comme les prédateurs, les ennemis ou les ouragans) qui menacent clairement tout le monde à un endroit donné. Il faut plus que la proximité physique et la co-vulnérabilité pour qu'une menace soit reconnue comme collective. Une compréhension réelle ou potentielle des aspects de la menace que nous partageons tous, dans un «nous» collectif [2,20] est également requise.

Une fois ancré dans l'idée qu'il affecte une petite fraction des gens, différents ou identiques à nous, les gens sont susceptibles de manquer ce que signifie une croissance exponentielle. Comme le roi dans la légende, une limitation cognitive nous fait manquer que le fait de placer deux grains de riz sur un échiquier, et de les multiplier par leur propre numéro carré après carré nous finira par nous ruiner, car cela ruinera tout le monde [...]

L'affiliation et la recherche de contacts comme notre plus gros problème actuel

Les agents pathogènes et les virus sont d'anciens problèmes évolutifs: de nombreux organismes évitent les contaminants et les individus infectés, et les individus infectés peuvent également rechercher l'isolement, arrêtant ainsi la propagation du virus. Nous, les humains, sommes également équipés de mécanismes (par exemple, le dégoût) pour éviter d'éventuels contaminants et nous empêcher d'être infectés [23,24]. De nombreuses études, des cas sensoriels aux cas de dégoût plus abstraits, suggèrent que ce mécanisme est très conservateur. Un cas d'intoxication alimentaire génère des réponses aversives durables au même aliment, ainsi qu'à des aliments similaires [...]
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Message par Invité Dim 12 Avr 2020 - 17:10


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Message par 404 Dim 12 Avr 2020 - 17:30

Je suis allé regardé de quoi parle ce type d'habitude, juste pour me faire une idée hein; je vous y invite, ça vaut le détour Very Happy
Moi quand un ufologue me parle de nouveau traitement miracle, tout de suite, j'ai un espoir intense qui naît!
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Message par Topsy Turvy Dim 12 Avr 2020 - 17:35

Je copie mon message d'hier sur f(x) 2.0 à ce sujet :

En résumé, le gars de la vidéo rapporte que le problème n'est pas tellement le virus mais plutôt la réaction inflammatoire (parfois appelée "tempête de cytokines"), et que le problème n'est pas tellement pulmonaire mais plutôt vasculaire (d'où l'absence d'oxygénation).

Oui, le premier problème, inflammatoire, ce n'est en fait pas nouveau. Et, oui, il y des troubles vasculaires, mais c'est en plus de troubles pulmonaires. Parce que, des troubles pulmonaires, il y en a, c'est même super visible en imagerie.

Maintenant, le médecin italien dont il est question, il est bien gentil, mais, là, il déconne. S'il a découvert ça tout seul, c'est bien, mais c'est discuté depuis un moment par les spécialistes du domaine, de manière plus sérieuse.
[...]
Si vous ventilez un poumon où le sang n'arrive pas, ce n'est pas utile! En fait, 9 décès sur 10 [cà, j'en sais rien, c'est égal, je ne pense pas qu'il sache plus, en fait], le problème est cardiovasculaire et non respiratoire! C'est la microthrombose veineuse, et non la pneumonie qui détermine la mort!
[...]
Pour moi, vous pouvez recommencer à jouer et rouvrir l'entreprise. Plus de quarantaine. Pas tout de suite. Mais le temps de publier ces données. Le vaccin peut arriver calmement. En Amérique et dans d'autres États qui suivent la littérature scientifique qui appelle à NE PAS utiliser d'anti-inflammatoires, c'est un désastre! Pire qu'en Italie. Et ce sont des médicaments anciens et bon marché.
https://buongiornonews.it/coronavirus-una-speranza-dalla-scoperta-del-prof-giannini/

Le problème est juste infiniment plus complexe que ça. Cette complexité est largement discutée dans l'abondante littérature spécialisée, dans les échanges informels entre médecins, etc.

Et, non, les "macrolides" (molécules à propriétés antibiotiques, qui ont des macrocycles de lactone souvent associés à des sucres neutres ou aminés [wikipédia]), ce n'est pas "le" (ni "un") "traitement miracle". Ce serait cool, certes. Mais, c'est pas ça.

L'idée même de traitement miracle, alors que les médecins ont vu passé et testé tout ce qu'ils avaient sous la main sur peut-être 350'000 cas (20% des 1'750'000 cas totaux), je propose d'abandonner l'idée. Ou alors un miracle de Pâques, tant qu'on y est. Mais je pense qu'il ne faut pas rêver.

Comme d'imaginer que 99% des gens resteraient asymptomatiques. Ce serait cool. Ce n'est juste pas ce qui est observé jusqu'ici. On en est encore plutôt à avancer 20 à 30%, avec un espoir fou à 50% dans une étude islandaise qui a malheureusement tourné court (par pénurie de tests).



PS: une nouvelle étude de Chine publiée il y a deux jours donne un taux d'asymptomatiques de ~6%. (Oui, 6, pas 60), je copie ce que j'ai mis sur f(x) à l'instant.

Le taux d'asymptomatiques, revu à la hausse par des Chinois :
[...]
Notre étude démontre que la prévalence de l'infection silencieuse de COVID-19 est de 5,8% (IC à 95%: 3,4 à 9,9%), ce qui est beaucoup plus élevé que les 1,2% qui ont été rapportés par le CDC chinois. Alors que les estimations la proportion asymptomatique est de 17,9% (IC à 95%: 15,5-20,2%) parmi les cas de COVID-19 à bord du bateau de croisière Diamond Princess au Japon. Nos résultats pourraient s'expliquer en partie par le fait que tous les cas infectieux silencieux de cette étude actuelle ont été trouvés à partir du dépistage des contacts étroits des cas positifs confirmés. Les patients atteints d'une infection silencieuse étaient également plus susceptibles d'être de jeunes adultes sans maladie chronique.
[...]
https://doi.org/10.1002/jmv.25861
He, G., Sun, W., Fang, P., Huang, J., Gamber, M., Cai, J. and Wu, J. (2020), The clinical feature of silent infections of novel coronavirus infection (COVID‐19) in Wenzhou. J Med Virol. Accepted Author Manuscript.
Publié le 10 avril.

De 1,2% à... 5,8%. On n'a pas fini de s'amuser, moi je dis.
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Message par Topsy Turvy Dim 12 Avr 2020 - 19:27

Juste pour le plaisir :
Sinha A. King Lear Under COVID-19 Lockdown. JAMA. Published online April 10, 2020. doi:10.1001/jama.2020.6186
https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2764654
King Lear sous confinement COVID-19

Récemment, un tweet de l'auteure-compositrice-interprète Rosanne Cash est devenu viral déclarant que Shakespeare avait écrit King Lear lors de la quarantaine liée à la peste. Bien que les mots soient destinés à affuter nos stylos, ils m'ont plutôt incitée à passer quelques heures solitaires à l'extérieur de l'hôpital à relire cette pièce monumentale. Largement considérée comme la tragédie la plus nuancée psychologiquement de Shakespeare, le roi Lear raconte l'histoire d'un roi âgé qui divise injustement son royaume, est trahi par ses héritiers et tombe dans la folie. La pièce m'a donné des frissons à plusieurs reprises, mais je n'avais jamais apprécié Lear qui délire dans la tempête comme je le fais maintenant dans la tempête de la nouvelle maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Bien que Lear passe une grande partie de la pièce à errer dans une lande désolée, sa confrontation avec un chaos indescriptible qui démantèle l'ordre ancien reflète la crainte existentielle de notre actualité. En tant que stagiaire en pédiatrie à New York, je m'étais tournée vers la pièce à la recherche du confort d'une histoire bien rodée. Ce qui a émergé, ce sont de nouvelles leçons qui reflètent le monde et les perspectives différentes que nous habitons maintenant.
[...]
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Message par siamois93 Dim 12 Avr 2020 - 20:34

Lord Brett a écrit:

Étonnante cette vidéo.
Je mets là le pdf avec le traitement mis en place par la médecin iséroise mentionnée dans la vidéo :
https://sfgg.org/media/2020/03/protocole-groupe-i-29-mars-2020-bis-suspicions-covid-19-docx.pdf
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Message par Topsy Turvy Dim 12 Avr 2020 - 20:57

Et totalement fausse, veuillez éditer vos messages et retirer cette vidéo de ce fil.
Merci.
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Message par Stegos Lun 13 Avr 2020 - 11:52

siamois93 a écrit:
Lord Brett a écrit:

Étonnante cette vidéo.
Je mets là le pdf avec le traitement mis en place par la médecin iséroise mentionnée dans la vidéo :
https://sfgg.org/media/2020/03/protocole-groupe-i-29-mars-2020-bis-suspicions-covid-19-docx.pdf

Grandiose, un document réel, technique, fait par un médecin pour informer ses pairs..

Repris des jours plus tard n'importe comment par un youtubeur, avec un titre putaclick, une demande de partage massif, et pour dénoncer la "vérité".

Bon, si le monsieur n'était pas "anti-pharmas", anti vaxx, et dénonceur des mensonges, ça serait mieux.

Et la cerise sur le gâteau, c'est quand on va regarder d'autres vidéos du monsieur, hein...

Alors ça commence avec des vaisseaux spatiaux, des signes illuminatis, des pyramides, j'en passe...

Il est copain avec quelqu'un qui voit des "Petit peuple de la nature"..

Et la preuve de sa rigueur scientifique...

CoronaPapers [Academic research] (SARS-CoV-2, covid-19, coronavirus, etc.) Scre1148

"Capture d'une entité non identifiée"
"Phénomène OVNIS: VOS Témoignages exceptionnels !"

Bon, il y a un fil pour ça... : Sornettes, complots moisis...

Ici, ça serait bien que ça reste scientifique, et pas "scientifique", on a jamais fait de la science en étant BAC-5, sur YOUTUBE, et à base de titres putaclik.
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Message par Topsy Turvy Lun 13 Avr 2020 - 12:19

Rappel 1 :
Topsy Turvy a écrit:Hello again,

J'ouvre un fil de présentations et discussions sur la recherche liée à SARS-CoV-2 et covid-19.
Eventuellement aussi sur des articles de vulgarisation par des correspondants spécialisés.

S'il vous plaît, ne pas trop y mêler les articles de presse non spécialisée. Et rien de sources obscures.
Si article de presse, alors plutôt dans l'idée de confronter les propos scientifiques et vulgarisés, please.
Rappel 2 :
Topsy Turvy a écrit:[...] veuillez éditer vos messages et retirer cette vidéo de ce fil.
Merci.

Lord Brett et Siamois93, merci d'éditer vos messages.
Je propose de ne conserver ici que la version de Stegos.
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Message par Stegos Lun 13 Avr 2020 - 14:13

ça me paraît un rien plus sérieux..

https://chemrxiv.org/articles/COVID-19_Disease_ORF8_and_Surface_Glycoprotein_Inhibit_Heme_Metabolism_by_Binding_to_Porphyrin/11938173
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