Cartographie du covid-19

Avertissement

Le texte qui suit est en cours de rédaction; critiquez-le tant que vous voudrez, mais tenez en compte.

Si vous voulez proposer un lien (que ce soit en intervenant sur ce fil ou en message privé), assurez-vous :
— qu'il contient une carte ou des données détaillées, et cela de façon actualisée au moins tous les jours;
— pour la carte, de préférence qu'elle soit insérable directement sur ce fil; pour les données qu'elles soient récupérables en tant que telles (et non insérées dans une image ou une vidéo).


Objectif

Il s'agit ici de tracer l'évolution de la progression du virus sous la forme de cartes détaillées (selon les pays ou territoires, mais aussi selon les régions des pays) de l'épidémie en cours. C'est-à-dire que je ne considère pas ce fil à proprement parler comme un fil de discussion (même si je souhaite qu'il le soit aussi) mais comme un document que j'actualiserai. Aussi, tout ce que j'y écrirai pourra être modifié au jour le jour, y compris sa structure. Notamment j'indique des notes pour moi-même, qui comportent des questions, et qui seront supprimées ulérieurement.

Au départ, je me suis basé sur la compilation effectuée par Topsy Turvy sur un autre fil, qu'il a citée ici :
https://www.zebrascrossing.net/t39751p300-fx-coronavirus-covid-19#1687439


Sources de données
Question : comment sont-elles collectées ?


Outils
Arc GIS
https://www.arcgis.com/index.html

Tableaux de bord Esri pour Arc GIS
https://www.esrifrance.fr/operations-dashboard.aspx


Cartes mondiales

Page de l'université John Hopkins
https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6
C'est la référence de carte mondiale.

Roylab Stats
https://www.youtube.com/watch?v=qgylp3Td1Bw1
C'est la référence mondiale d'actualisation en direct.

Early Alert
https://esrifrance.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/c23c9c5c3f124bb7b580d28634919702
La page semble moins actualisée que celle de JHU, mais elle détaille certaines régions.

OMS
https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/situation-reports
Une carte est actualisée; je ne sais pas comment l'obtenir directement.
https://who.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/c88e37cfc43b4ed3baf977d77e4a0667
La carte semble moins actualisée que celle de JHU.

Wikipédia timeline
https://en.wikipedia.org/wiki/Timeline_of_the_2019–20_coronavirus_pandemic

Our World in Data
https://ourworldindata.org/coronavirus
https://ourworldindata.org/grapher/total-covid-deaths-per-million (carte des contaminations)
https://ourworldindata.org/grapher/new-covid-deaths-per-million (carte des décès)
https://ourworldindata.org/grapher/total-confirmed-cases-of-covid-19-per-million-people (nombre de cas par million)
https://ourworldindata.org/grapher/new-covid-cases-per-million (nombre de décès par million)

Mapping the Novel Coronavirus Outbreak
https://storymaps.arcgis.com/stories/4fdc0d03d3a34aa485de1fb0d2650ee0
Je ne peux pas visualiser la carte.

Microsoft COVID-19 Tracker
https://www.bing.com/covid

HealthMap
https://www.healthmap.org/covid-19
Je ne peux pas visualiser la carte.

Novel Coronavirus (COVID-19) Infection Map
https://hgis.uw.edu/virus

Université de Virginie
https://nssac.bii.virginia.edu/covid-19/dashboard
La présentation est intéressante.


Cartes nationales, par continents ou grandes régions du monde

En commençant par l'Asie, je classe en gros de l'est à l'ouest et secondairement du nord au sud.


— Asie

Chine
https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6 (cliquer sur le pays dans la colonne de gauche)

Nouvelles :

Corée du Sud

Courbes :

— Océanie


— Europe

Allemagne
https://www.coronavirus.jetzt/karten/deutschland

Courbes :

Belgique

Nouvelles :

Espagne
https://experience.arcgis.com/experience/50d6c4c5599a43f4bebf517daa3a97b6

Courbes :

France
https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/infection-a-coronavirus/articles/infection-au-nouveau-coronavirus-sars-cov-2-covid-19-france-et-monde (données)
https://mapthenews.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/5e09dff7cb434fb194e22261689e2887 (carte)

Grande-Bretagne
https://www.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/f94c3c90da5b4e9f9a0b19484dd4bb14

Italie
http://opendatadpc.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/b0c68bce2cce478eaac82fe38d4138b1

Portugal
https://covid19.min-saude.pt/ponto-de-situacao-atual-em-portugal

Suisse
https://www.bag.admin.ch/bag/fr/home/krankheiten/ausbrueche-epidemien-pandemien/aktuelle-ausbrueche-epidemien/novel-cov/situation-schweiz-und-international.html


— Afrique


— Amérique du Nord

États-Unis
https://www.theguardian.com/world/ng-interactive/2020/mar/18/coronavirus-map-us-latest-cases-state-by-state
La carte est insérée dans la page.


— Amérique du Sud

Rien sur le reste du monde ?
Sur quels critères te limites-tu ? Le plus grand nombre de décès ?
A tout hasard, sur la Russie (non ce n'est pas RT) : https://youtu.be/renO_fPdDiQ

Attends, je n'ai pas encore commencé à travailler ! Là je me contente de reprendre l'excellente compilation de Topsy.

Par ailleurs, je ne vais pas regarder les vidéos ni lire les articles trop longs : il s'agit de cartographier, et pas d'interpréter, ou alors juste en fonction des cartes. Si vous voulez poster des éléments d'information à interpréter, s'il vous plaît interprétez-les vous-mêmes pour que je puisse en tenir compte.

Monde, par John Hopkins University :

https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html?fbclid=IwAR2WhPlT-xMYB58BAC6Te9KhM-p2Ppg_gQWasbBQK6DqS7k5x_ZcCiulgH4#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6

(carte, données par pays et courbes mondiales de contaminés, décès et guéris)

(le lien est long, excuses, mais si on le tronque après le .html, on nous demande de nous connecter)

Oui, c'est vrai, j'aurais dû aussi indiquer les cartes mondiales, ce que je corrige immédiatement.

Donne quelques cartes, mais surtout des chiffres en temps réel

https://www.youtube.com/watch?v=qgylp3Td1Bw&feature=emb_logo

Dans la description de la vidéo il y a quelques liens utiles pour les chiffres :
https://rospotrebnadzor.ru/region/korono_virus/epid.php
https://yandex.ru/web-maps/covid19?ll=84.091051%2C45.926087&z=3

Bon courage ...

Topsy, il me faut forcément prendre en compte les données numériques, et indiquer les sources en référence, mais il n'est pas question de faire doublon avec le sujet de Stegos ou avec le tien. Là c'est la visualisation globale détaillée qui m'intéresse.

Il n'y a pas de souci à créer plein de fils dans J'aime les sciences, au contraire...
Surtout maintenant que la petite grippounette commence à intéresser du monde.
J'avais justement très envie d'un message où soient rassemblées des liens data & co.
Et je pense que tout le monde, à commencer par moi, préfère que chacun participe.

Merci Pieyre !

Je compte bien sûr tenter par moi-même de collecter toutes les cartes; mais je m'occupe aussi de la structure de mon document, et je ne peux pas tout faire en même temps.

Alors je me permets de solliciter les membres de ce forum.

Je commence par la principale carte qui me manque, celle de la Chine. Ce que j'aimerais avoir, c'est une page internet qui présente la carte des contaminations (ou des personnes contaminantes, ou des décès ou des guérisons) par subdivisions du pays, et cela de façon actualisée tous les jours, comme celle qui est présentée sur le direct du Roy Lab.

Pour la Chine, je ne sais pas si on a des chances de trouver une bonne carte.
John Hopkins présente les provinces sous l'onglet Province/State/Dependency.
Il y a aussi deux onglets, avec rouge pour cas totaux et orange pour cas actifs.

Merci ! Le problème, c'est que je ne peux toujours pas visualiser les cartes du JHU. Il va falloir que je règle enfin ça; sinon ça ne va pas être sérieux. Mais je peux toujours indiquer les liens qui présentent les cartes que je ne vois pas : il s'agit juste que les autres les voient.

Il est assez intéressant de noter les différences de politique concernant la localisation des malades : en France, on procède par région mais surtout pas par commune (alors que ça aurait du sens, ne serait-ce que par souci de transparence, ou pour rassurer/inquiéter ceux qui doivent l'être), alors qu'en Chine (ou en Corée ?), la localisation est indiquée semble-t-il avec une précision extrême, jusqu'aux immeubles.

Par exemple, "Grand Est" inclut Mulhouse et Troyes, or la situation y est nettement différente (en tout cas pour le moment).

Pensez-vous qu'il aurait fallu (ou faudrait) un degré de précision supérieur, en France ?

Je ne vais pas me prononcer ici sur la politique, parce que ce n'est pas mon sujet. Mais il est certain que la précision, c'est bien la perspective qui me conduit à m'intéresser aux cartes : être au plus près des données concernant les phénomènes que l'on étudie.

Il est question pour moi d'atteindre à un degré de précision tel que les phénomènes peuvent être interprétés d'une façon topologique, voire selon une mécanique des fluides, c'est-à-dire de façon quasi-continue.

À cet égard, si je peux comprendre qu'en France on ne veuille pas indiquer si dans telle commune il y a tant de cas (en effet, il y en a de petites, et cela pourrait provoquer... je ne sais quoi : inimitié envers tel ou tel, panique, exode ?), pour autant je ne comprends pas qu'on ne rende pas davantage public le nombre de cas par départements, ou même par cantons.

En Chine, tout le monde savait non seulement où habitaient les cas détectés, mais aussi par où ils étaient passés faire leur course, manger, etc. Et aussi s'ils venaient d'être détectés où si c'était moins récent.

Les premières cartes en France disaient beaucoup trop de choses, on pouvait savoir qui c'était, ce qui ne me semble pas très correct, même si ça peut être "pratique".

https://infogram.com/coronavirus-en-france-1h1749mjrqkq6zj?live

Ah, oui... ce degré de précision, c'est impressionnant. J'en avais entendu parler, mais je ne pensais pas que c'était à ce point.

D'un point de vue statistique, tout ce qui est individuel compte, de façon à effectuer des calculs sur tous les paramètres qu'on peut. Mais cela compte pour l'algorithme, pas pour le grand public.

Avec tout ça, il y a plein de pays qui me posent problème (comme à tout le monde, mais vous me permettrez de faire le naïf) : qu'en est-il de la Corée du Nord... ce n'est pas la peine de répondre qu'on n'en sait rien; d'ailleurs sa situation n'est sans doute pas très importante pour les pays voisins; mais qu'en est-il de la Syrie et de la Lybie, qui ne sont pas autant isolées malgré les menées guerrières qui s'y déroulent ?

Bon, c'était juste pour indiquer ce que je remarque, mais je retourne à mes recherches concernant ce qui est accessible.

Les cas exposés par Pieyre sont importants, mais la plus grosse interrogation concerne la Russie et son nombre dérisoire de cas reconnus (alors que le pays connaît une étrange augmentation du nombre de pneumonies).

L'évolution de l'Iran en comparaison avec celle de l'Italie à aussi de quoi surprendre.

Corée :

Kim Jong-un donne la priorité au projet hospitalier de Pyongyang
http://english.chosun.com/site/data/html_dir/2020/03/20/2020032002783.html
March 20, 2020 12:40

Des soldats nord-coréens sont morts de fièvre et de problèmes respiratoires
https://www.dailynk.com/english/north-korean-soldiers-die-after-suffering-fevers-breathing-problems/
2020.03.20 9:07am

J'ajoute une clause dans mon avertissement liminaire.

Si vous voulez proposer un lien (que ce soit en intervenant sur ce fil ou en message privé), assurez-vous :
— qu'il contient une carte ou des données détaillées, et cela de façon actualisée au moins tous les jours;
— pour la carte, de préférence qu'elle soit insérable directement sur ce fil; pour les données qu'elles soient récupérables en tant que telles (et non insérées dans une image ou une vidéo).

Maintenant, j'accepte toute information, mais de préférence cela.

USA
https://www.theguardian.com/world/ng-interactive/2020/mar/18/coronavirus-map-us-latest-cases-state-by-state
ou
https://www.npr.org/sections/health-shots/2020/03/16/816707182/map-tracking-the-spread-of-the-coronavirus-in-the-u-s?t=1584781619737
év
https://abcnews.go.com/Health/coronavirus-map-tracking-spread-us-world/story?id=69415591

New-York State
https://www.syracuse.com/coronavirus/2020/03/see-new-york-state-map-of-coronavirus-cases-county-by-county.html
New-York City
http://nycitylens.com/2020/03/map-coronavirus-spreads-new-york-state/

Massachusetts
https://www.wbur.org/commonhealth/2020/03/09/coronavirus-cases-massachusetts-map

California State
https://www.sacbee.com/news/california/article240712141.html
ou
San-Francisco Bay
https://www.mercurynews.com/2020/03/04/map-coronavirus-cases-in-the-bay-area/

Washington State
https://www.thenewstribune.com/news/state/washington/article240808761.html

Sans garantie que ce soit le meilleur choix, of course.

Merci ! Je vais explorer ça et noter ce que j'en retiens dans mon message introductif.

Par ailleurs, au niveau mondial, j'ajoute cela :

Early Alert
https://esrifrance.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/c23c9c5c3f124bb7b580d28634919702

OMS
https://who.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/c88e37cfc43b4ed3baf977d77e4a0667

Les deux tableaux de bord ne me semblent pas aussi actualisés que celui de l'université Johns Hopkins, ce qui pose la question de la multiplication de telles présentations. Le premier indique des données par subdivisions des États, ce qui est pourtant intéressant.

Ils sont complémentaires.
J'aime bien Early Alert, merci.

Une carte mondiale que je découvre et qui me plaît bien, même si les pays sont colorés uniformément, c'est celle-ci :

https://hgis.uw.edu/virus

Je sélectionne l'option ESRI Satellite. C'est peut-être moins angoissant, mais cela me semble bien correspondre au fait que notre monde est une terre, avec des zones de climat différenciées.

Quoi, le virus est détecté depuis l'espace ?

Hello Pieyre,
si tu repasses par ici (ce que j'espère)
volontiers cette carte aussi pour la France :
https://dashboard.covid19.data.gouv.fr
(pas du tout sexy mais très lisible)

Nextstrain Real-time tracking of pathogen evolution

Nextstrain is an open-source project to harness the scientific and public health potential of pathogen genome data. We provide a continually-updated view of publicly available data alongside powerful analytic and visualization tools for use by the community. Our goal is to aid epidemiological understanding and improve outbreak response.