Brèves de Labo

The riddle of how humans evolved to have fathers
By Elizabeth Preston
28th June 2021
From Knowable Magazine

Few other mammalian dads invest as much time and care in rearing their offspring – or even the children of others – than human fathers.
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https://www.bbc.com/future/article/20210625-the-riddle-of-how-humans-evolved-to-have-fathers

Beyond coronavirus: the virus discoveries transforming biology
Amber Dance - Nature News Feature - 30 June 2021

SARS-CoV-2 is just one of nonillions of viruses on our planet, and scientists are rapidly identifying legions of new species.
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There are just 9,110 named species listed by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), but that’s obviously a pitiful fraction of the total. In part, that’s because officially classifying a virus used to require scientists to culture a virus in its host or host cells — a time-consuming if not impossible process. It’s also because the search has been biased towards viruses that cause diseases in humans or organisms we care about, such as farm animals and crop plants. Yet, as the COVID-19 pandemic has reminded us, it’s important to understand viruses that might jump from one host to another, threatening us, our animals or our crops.

Over the past ten years, the number of known and named viruses has exploded, owing to advances in the technology for finding them, plus a recent change to the rules for identifying new species, to allow naming without having to culture virus and host. One of the most influential techniques is metagenomics, which allows researchers to sample the genomes in an environment without having to culture individual viruses. Newer technologies, such as single-virus sequencing, are adding even more viruses to the list, including some that are surprisingly common yet remained hidden until now. It’s an exciting time to be doing this kind of research, says Breitbart. “I think, in many ways, now is the time of the virome.”

In 2020 alone, the ICTV added 1,044 species to its official list, and thousands more await description and naming. This proliferation of genomes prompted virologists to rethink the way they classify viruses and helped to clarify their evolution. There is strong evidence that viruses emerged multiple times, rather than sprouting from a single origin.
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Schulz, now a microbiologist at the US Department of Energy Joint Genome Institute in Berkeley, California, decided to search for related viruses in metagenome data sets. In 2020, in a single paper, he and his colleagues described more than 2,000 genomes from the group that contains giant viruses; before that, just 205 such genomes had been deposited in public databases.
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Metagenomics has turned up a wealth of viruses, but it ignores many, too. RNA viruses aren’t sequenced in typical metagenomes, so microbiologist Colin Hill at University College Cork, Ireland, and his colleagues looked for them in databases of RNAs, called metatranscriptomes. Scientists normally use these data to understand the genes in a population that are actively being turned into messenger RNA in to make proteins, but RNA virus genomes can show up, too. Using computational techniques to pull sequences out of the data, the team found 1,015 viral genomes in metatrancriptomes from sludge and water samples5. Again, they’d massively increased the number of known viruses with a single paper.
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The James Bond of ocean viruses lacks an official Latin species name, and so do most of the thousands of viral genomes discovered by metagenomics over the past decade. Those sequences presented the ICTV with a dilemma: is a genome enough to name a virus? Until 2016, proposing a new virus or taxonomic group to the ICTV required scientists to have that virus and its host in culture, with rare exceptions. But that year, after a contentious but cordial debate, virologists agreed that a genome was sufficient.
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The original ICTV viral classification, which is entirely separate from the tree of cellular life, included only the lower rungs of the evolutionary hierarchy, from species and genus up to the order level — a tier equivalent to primates or trees with cones in the classification of multicellular life. There were no higher levels. And many viral families floated alone, with no links to other kinds of virus. So in 2018, the ICTV added higher-order levels: classes, phyla and kingdoms.

At the very top, it invented ‘realms’, intended as counterparts to the ‘domains’ of cellular life — Bacteria, Archaea and Eukaryota — but using a different word to differentiate between the two trees. (Several years ago, some scientists suggested that certain viruses might fit into the cell-based evolutionary tree, but that idea has not gained widespread favour.)
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As to how the realms arose, virologists have several ideas. Perhaps they descended from independent genetic elements at the dawn of life on Earth, before cells even took shape. Maybe they escaped or ‘devolved’ from whole cells, ditching most of the cellular machinery for a minimal lifestyle. Koonin and Krupovic favour a hybrid hypothesis in which those primordial genetic elements stole genes from cellular life to build their virus particles. Because there are multiple origins for viruses, it’s possible there are multiple ways they’ve originated, says Kuhn, who also served on the ICTV committee and worked on the new taxonomy proposal.

Thus, although the viral and cellular trees of life are distinct, the branches touch, and genes pass between the two. Whether viruses count as being ‘alive’ depends on your personal definition of life. Many researchers do not consider them to be living things, but others disagree. “I tend to believe that they are living,” says Hiroyuki Ogata, a bioinformatician working on viruses at Kyoto University in Japan. “They are evolving, they have genetic material composed of DNA and RNA, and they are very important in the evolution of all life.”

The current classification is widely recognized as just the first attempt, and some virologists say it’s a bit of a mess. A score of families still lack links to any realm. “The good point is, we are trying to put some order in that mess,” says Martinez-Garcia.
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With viruses, “finding them’s actually the easy part”, she says. Picking apart how viruses influence host life cycles and ecology is much trickier. But first, virologists must answer one of the toughest questions of all, Breitbart says: “How do you pick which one to study?”

Nature 595, 22-25 (2021)
https://doi.org/10.1038/d41586-021-01749-7

Vaccine made of live malaria parasites shows early success
Heidi Ledford - 30 June 2021 - Nature News

Strategy uses a combination of parasites and medicines to generate immunity while avoiding symptoms.
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The results of the trial are promising, but producing whole-sporozoite vaccines on the scale needed to combat malaria would present a challenge. The sporozoites must be harvested from mosquito salivary glands and then stored at extremely low temperatures, complicating their distribution in resource-poor areas. No vaccine has ever been mass-produced using mosquitoes before. Alonso remembers someone asking him about the possibility years ago: “It is a crazy idea,” he replied at the time.

But Sanaria, a biotechnology company in Rockville, Maryland, has been working to make sporozoite vaccines more practical. The company, which collaborated on the vaccine study, can now make large quantities of sporozoites and is working on ways to do so without mosquitoes. “It’s amazing what has been accomplished in terms of the science and technologies that have been developed along the way,” says Alonso.

Sanaria is also working with researchers to use gene-editing techniques such as CRISPR-Cas9 to genetically weaken the parasite, so that it can be injected live without the need for additional medicines. An edited sporozoite might replicate a few times and then die, before it has a chance to cause symptoms.

Ultimately, several vaccine options will probably be needed in the fight against malaria, says Duffy. “There’s probably not going to be a single vaccine solution,” he says.

Malaria control measures, including mosquito nets and preventive medicines, have saved more than 7 million lives and prevented 1.5 billion malaria cases in the past decade, Alonso says. But these measures are being challenged by insecticide resistance, drug resistance and population growth. Each year, 400,000 people die from malaria — most of them children.

“We’ve plateaued at an unacceptably high level,” says Alonso. “Unless we have a highly efficacious malaria vaccine, it’s going to be very hard to keep making progress.”
https://doi.org/10.1038/d41586-021-01806-1

En image : des scarabées de 230 millions d’années découverts dans une crotte fossilisée

Les minuscules coléoptères ont probablement été mangés par un des ancêtres des dinosaures. C’est le rayonnement synchrotron qui a permis d’en détecter la présence dans le coprolithe.



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A connectomic study of a petascale fragment of human cerebral cortex

Abstract
We acquired a rapidly preserved human surgical sample from the temporal lobe of the cerebral cortex. We stained a 1 mm3 volume with heavy metals, embedded it in resin, cut more than 5000 slices at ∼30 nm and imaged these sections using a high-speed multibeam scanning electron microscope. We used computational methods to render the three-dimensional structure of 50,000 cells, hundreds of millions of neurites and 133.7 million synaptic connections. The 1.4 petabyte electron microscopy volume, the segmented cells, cell parts, blood vessels, myelin, inhibitory and excitatory synapses, and 100 manually proofread cells are available to peruse online. Despite the incompleteness of the automated segmentation caused by split and merge errors, many interesting features were evident. Glia outnumbered neurons 2:1 and oligodendrocytes were the most common cell type in the volume. The E:I balance of neurons was 69:31%, similar to the ratio of excitatory versus inhibitory synapses in the volume, which was 63:37%. The E:I ratio of synapses was significantly higher on pyramidal neurons than inhibitory interneurons. We found that deep layer excitatory cell types can be classified into subsets, based on structural and connectivity differences, that chandelier interneurons not only innervate excitatory neuron initial segments as previously described, but also each other’s initial segments. Furthermore, among the thousands of weak connections established on each neuron, there exist rarer highly powerful axonal inputs that establish multi-synaptic contacts (up to ∼20 synapses) with target neurons. Our analysis indicates that these strong inputs are specific, and allow small numbers of axons to have an outsized role in the activity of some of their postsynaptic partners.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.29.446289v2.full

[...] une équipe internationale de scientifiques a mis au point un système qui combine les informations du connectome cérébral – les connexions neuronales – et l’apprentissage machine pour évaluer et établir les pronostics de rétablissement post-AVC.

Lorsque le flux sanguin vers le cerveau est quelque peu réduit ou restreint, un AVC (ou «attaque ischémique cérébrale» dans le jargon médical) peut survenir. L’AVC fait partie des pathologies qui semblent assez courantes. En effet, rien qu’en Europe, on recense plus de 1,5 million de nouveaux cas chaque année.

Certains AVC peuvent être mortels. Lorsqu’ils ne le sont pas, ils altèrent souvent sévèrement la mobilité des personnes qui en sont victimes. En fait, l’AVC est aujourd’hui l’une des principales causes d’invalidité à long terme. Le rétablissement peut être long et difficile. En Europe, moins de 15 % des patients se rétablissent complètement, et 3,7 millions d’entre eux ont des séquelles persistantes. En clair, c’est un problème médical qui doit être réglé de toute urgence.

Or la rééducation est complexe. Les AVC peuvent survenir dans différentes aires cérébrales, touchant différents systèmes du cerveau. Les patients qui suivent une rééducation présentent des «résultats hétérogènes», ce qui signifie que le rétablissement peut être très différent d’un individu à l’autre.

«La solution est de trouver la meilleure stratégie de neurorééducation pour optimiser les résultats des traitements individuels» [...]
[...]
Les connectomes sont générés par l’analyse de plusieurs images provenant de l’imagerie par résonance magnétique et par la reconstruction des connexions structurelles ou fonctionnelles du cerveau de manière non invasive et in vivo. Aujourd’hui, les connectomes sont des outils indispensables pour les neuroscientifiques, notamment lorsqu’ils souhaitent interpréter les données cérébrales structurelles ou dynamiques et les associer à des fonctions, des déficits fonctionnels ou des processus de rétablissement. En bref, le connectome montre comment sont les connexions cérébrales pour contrôler le corps et ses fonctions, ce qui le rend important pour élaborer la meilleure approche de rétablissement d’une personne victime d’un AVC.
[...]
Les scientifiques ont entré les informations sur les connectomes dans une «machine à vecteurs de support» ou SVM. Il s’agit d’un type de modèle d’apprentissage machine qui utilise des exemples pour mapper une entrée sur une sortie. Les SVM sont particulièrement utiles pour la classification, où elles séparent les éléments et les classent correctement, par exemple les e-mails spam et les e-mails non-spam.

Dans cette étude, les chercheurs ont entraîné les SVM à faire la distinction entre les patients ayant un rétablissement naturel et ceux sans rétablissement naturel, en se basant sur les connectomes structurels de l’ensemble de leur cerveau. Les SVM ont ensuite défini le modèle de réseau cérébral sous-jacent de chaque patient, en ciblant ceux qui ont été sévèrement touchés pour établir des pronostics sur leur potentiel de rétablissement, la précision de chaque pronostic étant contre-validée en interne et en externe avec des ensembles de données indépendants.

Le résultat est un outil de pointe pour la médecine personnalisée: un système d’apprentissage machine qui est capable d’identifier les modèles de réseau neuronal pour établir des pronostics très précis sur les résultats de rétablissement post-AVC. «Cet outil peut aider à établir très tôt les pronostics de rétablissement individuel et aura des répercussions importantes sur la prise en charge clinique, la recherche translationnelle et le choix de traitement», conclut Friedhelm Hummel.
https://actu.epfl.ch/news/le-machine-learning-ameliore-le-pronostic-de-retab/

Confiteor a écrit:Frimeuse, pour l'instant tu n'as qu'une paire (hum ...).

Molecular topography of an entire nervous system.

Abstract
We have produced gene expression profiles of all 302 neurons of the C. elegans nervous system that match the single-cell resolution of its anatomy and wiring diagram. Our results suggest that individual neuron classes can be solely identified by combinatorial expression of specific gene families. For example, each neuron class expresses distinct codes of ∼23 neuropeptide genes and ∼36 neuropeptide receptors, delineating a complex and expansive "wireless" signaling network. To demonstrate the utility of this comprehensive gene expression catalog, we used computational approaches to (1) identify cis-regulatory elements for neuron-specific gene expression and (2) reveal adhesion proteins with potential roles in process placement and synaptic specificity. Our expression data are available at https://cengen.org and can be interrogated at the web application CengenApp. We expect that this neuron-specific directory of gene expression will spur investigations of underlying mechanisms that define anatomy, connectivity, and function throughout the C. elegans nervous system.

Taylor SR, Santpere G, Weinreb A, Barrett A, Reilly MB, Xu C, Varol E, Oikonomou P, Glenwinkel L, McWhirter R, Poff A, Basavaraju M, Rafi I, Yemini E, Cook SJ, Abrams A, Vidal B, Cros C, Tavazoie S, Sestan N, Hammarlund M, Hobert O, Miller DM 3rd. Molecular topography of an entire nervous system. Cell. 2021 Jul 2:S0092-8674(21)00758-3. doi: 10.1016/j.cell.2021.06.023. Epub ahead of print. PMID: 34237253.
https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.06.023

Cauliflower fractal forms arise from perturbations of floral gene networks

Vegetal fractals
Cauliflower, along with dahlias and daisies, develop as phyllotactic spirals. Azpeitia et al. combined modeling with experimental investigation to clarify the gene-regulatory network that sets up a multitude of undeveloped flowers to form a cauliflower curd. Irrepressible inflorescence identity genes in the context of dysfunctional meristems and slow internode elongation result in piles of incomplete flowers. If meristem size drifts during organogenesis, then the conical structures of the Romanesco form emerge in fractal formation.

Abstract
Throughout development, plant meristems regularly produce organs in defined spiral, opposite, or whorl patterns. Cauliflowers present an unusual organ arrangement with a multitude of spirals nested over a wide range of scales. How such a fractal, self-similar organization emerges from developmental mechanisms has remained elusive. Combining experimental analyses in an Arabidopsis thaliana cauliflower-like mutant with modeling, we found that curd self-similarity arises because the meristems fail to form flowers but keep the “memory” of their transient passage in a floral state. Additional mutations affecting meristem growth can induce the production of conical structures reminiscent of the conspicuous fractal Romanesco shape. This study reveals how fractal-like forms may emerge from the combination of key, defined perturbations of floral developmental programs and growth dynamics.

Azpeitia E, Tichtinsky G, Le Masson M, Serrano-Mislata A, Lucas J, Gregis V, Gimenez C, Prunet N, Farcot E, Kater MM, Bradley D, Madueño F, Godin C, Parcy F.
Cauliflower fractal forms arise from perturbations of floral gene networks.
Science. 2021 Jul 9;373(6551):192-197.
https://science.sciencemag.org/content/373/6551/192

Why fish are becoming addicted to illegal drugs
By Matt Parker and Alex Ford
19th July 2021

Trout enjoy water that contains methamphetamine – could this lead to them loitering around sewage pipes?
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*Matt Parker is a Senior Lecturer in Neuroscience and Psychopharmacology at the University of Portsmouth. Alex Ford is a Professor of Biology at the University of Portsmouth
This article originally appeared on The Conversation, and is republished under a Creative Commons licence.
https://www.bbc.com/future/article/20210716-why-fish-are-becoming-addicted-to-illegal-drugs

How Many Numbers Exist? Infinity Proof Moves Math Closer to an Answer.
Natalie Wolchover

For 50 years, mathematicians have believed that the total number of real numbers is unknowable. A new proof suggests otherwise.

There are an infinite number of infinities. Which one corresponds to the real numbers?

In October 2018, David Asperó was on holiday in Italy, gazing out a car window as his girlfriend drove them to their bed-and-breakfast, when it came to him: the missing step of what’s now a landmark new proof about the sizes of infinity. “It was this flash experience,” he said.

Asperó, a mathematician at the University of East Anglia in the United Kingdom, contacted the collaborator with whom he’d long pursued the proof, Ralf Schindler of the University of Münster in Germany, and described his insight. “It was completely incomprehensible to me,” Schindler said. But eventually, the duo turned the phantasm into solid logic.

Their proof, which appeared in May in the Annals of Mathematics, unites two rival axioms that have been posited as competing foundations for infinite mathematics. Asperó and Schindler showed that one of these axioms implies the other, raising the likelihood that both axioms — and all they intimate about infinity — are true.

“It’s a fantastic result,” said Menachem Magidor, a leading mathematical logician at the Hebrew University of Jerusalem. “To be honest, I was trying to get it myself.”

Most importantly, the result strengthens the case against the continuum hypothesis, a hugely influential 1878 conjecture about the strata of infinities. Both of the axioms that have converged in the new proof indicate that the continuum hypothesis is false, and that an extra size of infinity sits between the two that, 143 years ago, were hypothesized to be the first and second infinitely large numbers.

“We now have a coherent alternative to the continuum hypothesis,” said Ilijas Farah, a mathematician at York University in Toronto.

The result is a victory for the camp of mathematicians who feel in their bones that the continuum hypothesis is wrong. “This result is tremendously clarifying the picture,” said Juliette Kennedy, a mathematical logician and philosopher at the University of Helsinki.

But another camp favors a different vision of infinite mathematics in which the continuum hypothesis holds, and the battle between these sides is far from won.

“It’s an amazing time,” Kennedy said. “It’s one of the most intellectually exciting, absolutely dramatic things that has ever happened in the history of mathematics, where we are right now.”
[...]

Expanding American Sign Language’s scientific vocabulary
by Leigh Krietsch Boerner
July 11, 2021
A lack of signs for many scientific terms impedes deaf people’s entry into the sciences. Deaf scientists want to chip away at the barriers by developing more ASL signs for scientific terms.
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Clark says she was frustrated because she could understand the scientific concepts explained in the lecture but not how the interpreters were signing the information. Eventually, Sheikh’s class got a consistent interpreter named Todd Thieu who had interpreted for organic chemistry before and understood the concepts. “We started negotiating a common vocabulary,” Sheikh says.

As a result, the small group of deaf students always had the best grades in class. This got the attention of the professor, Christina Goudreau Collison. Along with tutor Jennifer Swartzenberg, she encouraged the students to develop and record a series of ASL signs for organic chemistry. The group of deaf students got together twice a week for over a year to develop these signs, Sheikh says. “We’d be there for hours late at night. We were all really invested,” she says. “It was a real passion project.” Many of these signs are now posted online by ASLCore, a group of interpreters and deaf students based out of NTID that has developed advanced ASL signs in several disciplines.

Deaf scientists think about multiple factors when they develop scientific signs, Houghton says. First, they must evaluate whether the sign complies with the linguistic rules of ASL. Good signs will follow the patterns and parameters of ASL in terms of the shape of the signer’s hands, how the sign moves, and where in space it’s signed. “It has to follow those ASL rules,” Houghton says. “If it doesn’t, it doesn’t feel right.”

Next, deaf scientists need to assess how conceptually accurate the sign is. Sometimes a sign that follows the linguistic rules and is conceptually accurate already exists in ASL. When Houghton’s group found one of those signs for quantum physics terms, it left the sign as is. “If it’s something that already makes sense and works perfectly in conversation, that’s not something that we would modify,” she says. But if it doesn’t follow the rules or is confusing, that’s when the work starts.

One way a sign might be conceptually inaccurate is if it’s an anglicized sign, meaning it’s based on how something is spelled in English, ASL Clear’s Reis says. For example an older sign for “atom” is a signed letter “A” circling in the air. “This is not at all what an atom is” conceptually, she says.

The organic chemistry ASLCore team drew inspiration from the images used in the students’ textbook, Sheikh says. “We wanted to be able to represent organic chemistry terms in a way that was simple and easily understandable.” This means not only how things look, statically, but also the way things move, Sheikh says. For example, the sign the team developed for steric hindrance was two curved hands, placed back to back, tapping against each other. “It represents the two curves that you often see as a symbol in textbooks” for two atoms running into each other, Sheikh says.

Sign developers also have to consider the context in which a term is used and how that affects its meaning. For example, one ASL sign for “electron” shows a single finger wiggling in the air. This makes sense if you’re talking about free electrons, Gallaudet’s Wooten says. But in a general chemistry class, when you’re thinking about electrons orbiting a nucleus in an atom, that sign is not as conceptually accurate. In that case, it makes sense to use the ASL sign for electron that shows a finger circling a closed fist.

Because of differing contexts, there can be multiple signs for the same concept. Just on ASLCore alone, there are five signs for the word “molecule”: one in chemistry, one in physics, and three in biology. The organic chemistry team didn’t make new signs for a lot of the concepts already presented in the physics or biology sections. But the way the other teams signed “molecule” didn’t quite match what the chemists wanted to convey, Clark, a member of the ASLCore group, says. Conceptually, the biology signs are more based on large biomolecules like proteins, while the physics sign, two cupped hands rotating relative to each other, didn’t show how a molecule might interact with other molecules. So the chemists developed their own sign, depicting two molecules near each other. “When we look at a molecule, we’re not always looking at the molecule by itself,” Clark says. “It’s reacting with other molecules.”

With multiple groups creating scientific signs and old signs still floating around, how do people know which one to use? This question hits upon an issue that all languages face, spoken or signed: no one person or group controls a language.

For example, consider the sign for “bacteria.” In the past, people used the sign for “bug,” as in an insect, similar to how the word is sometimes used in English. ASL now has a separate sign for “bacteria,” but some scientists continue to use the one for “bug” because it’s ingrained, Wooten says. “People just like some signs better than others. They’re easier to sign or more intuitive or fit the context better,” she says.

Because of this variability in the use of signs, professors have to work with their students to decide which signs to use for each class, Wooten says. There are even differences in the same university across programs, Lundberg says. Wooten’s intro to biology class and Lundberg’s intro to chemistry class usually include the same students at the same time. As a result, the students may see two signs for the same concept. Sometimes the students protest when a professor introduces a sign they’re not used to. When she used one of the signs for “electron,” students didn’t like it at first, Wooten says. “They asked me to actually go back and to use a sign that had been more of an original sign.”
[...]
Sometimes useful signs pop up and then feed off one another. One of the math signs that ASL Clear developed was for “fraction.” The old sign was anglicized: the sign for the letter “F” over then under a finger held horizontally, Reis says. The ASL Clear team swapped in the sign for “digit” instead of “F.” “If you put this handshape over that handshape, now what you’re representing is an unknown digit over an unknown digit, which is the actual definition, right?”

This sign later inspired the one for “ratio” developed by the Quantum Science in ASL group. While having a conversation, “we’re spelling ‘ratio’ over and over and over,” Houghton says. Then one person used the sign for “fraction” but tipped it on its side to show a digit next to a digit, separated by a vertical finger. “We were all like, ‘Whoa, that actually makes a lot of sense,’ ” Houghton says. Because the sign for “fraction” was already in their minds, the sign for “ratio” felt comfortable and easy to use, she says.
[...]

One Hundred Years of Insulin for Some
Amy Moran-Thomas, Ph.D.

In July 1921, researchers in Canada isolated the hormone insulin. This discovery profoundly changed the lives of people with diabetes. But insulin remains unaffordable and inaccessible in many parts of the world.

Accès restreint: https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp2105697

[...]
Le rôle du pancréas dans la maladie diabétique a été découvert par Oskar von Minkowski, en 1889 à Strasbourg[/b], lorsque son assistant lui a signalé que les chiens opérés la veille avaient soif et que leurs urines attiraient les mouches… [...] ]Plusieurs chercheurs ont préparé des extraits de pancréas dans le but de purifier un extrait qui pourrait avoir une utilité thérapeutique chez les diabétiques. Nicolae Paulescu a été un précurseur important, mais ses préparations peu purifiées n'étaient pas utilisables. Les meilleurs extraits ont été préparés par Frederick Grant Banting avec l'aide de Charles Best, un étudiant en médecine, dans le laboratoire de John James Rickard Macleod au cours de l'été 1921 à Toronto. Le premier produit, préparé par Banting et Best, peu actif et très impur, a ouvert la voie au traitement du diabète grâce au travail magistral et ultra-rapide de J. B. Collip, un biochimiste, qui a, en quelques semaines, préparé un extrait relativement pur et utilisable à des fins thérapeutiques. Il est testé chez l'être humain pour la première fois en 1922. Banting et Macleod ont été, dès 1923, les lauréats du Prix Nobel de physiologie et de médecine, récompensant leurs travaux.
[...]
Les premières insulines étaient purifiées à partir de pancréas de bœuf et de porc. Dans les années 1930, diverses préparations ont permis d'obtenir des formes d'action prolongée de l'insuline par cristallisation en présence de zinc, ou prolongation de temps de résorption sous la peau par l'adjonction de protamine (insuline NPH, préparée par Hagedorn).

Depuis le début des années 1980, les insulines sont synthétisées par des organismes génétiquement modifiés. La plupart des pays ont ainsi abandonné la préparation d'insuline à partir de pancréas de bœuf dans les suites de la maladie de la vache folle, quoiqu'aucun cas de transmission de virus ou prion par l'insuline n'ait jamais été observé.[...]
https://fr.wikipedia.org/wiki/Insuline

Technique, mais intéressant justement pour les aspects "advances in biotechnology" :

Pourquoi les roux ressentent-ils la douleur différemment ?
Julie Kern (publié le 10/04/2021, modifié le 22/04/2021)

Blond vénitien, poil de carotte, cuivré ou encore auburn, il existe probablement cinquante nuances de roux. La plupart des roux portent une mutation sur le gène MC1R qui code pour le récepteur de la mélanocortine 1 (il y en a cinq connus) présent sur les mélanocytes, mais d'autres gènes sont aussi impliqués dans cette couleur de cheveux.

Dysfonctionnel chez les roux, il ne reconnait plus l'hormone mélanotrope (MSH) et ne produit alors qu'un seul type de mélanine, le pigment responsable de la couleur de la peau, des cheveux et des poils, la phéomélanine. La couleur de ce pigment va du jaune au brun, et est responsable de toutes les teintes de roux.

Mais ce n'est pas la seule conséquence de cette mutation. En effet, depuis une quinzaine d'années, les scientifiques savent que les souris et les humains portant le gène MC1R muté ressentent la douleur différemment des autres. Selon les observations, les roux ont un seuil basal de tolérance à la douleur, ou nociception, plus haut que les autres, et ils sont plus sensibles aux analgésiques opioïdes.
[...]
https://www.futura-sciences.com/sante/actualites/genetique-roux-ressentent-ils-douleur-differemment-86669/

Reduced MC4R signaling alters nociceptive thresholds associated with red hair

Abstract
Humans and mice with natural red hair have elevated basal pain thresholds and an increased sensitivity to opioid analgesics. We investigated the mechanisms responsible for higher nociceptive thresholds in red-haired mice resulting from a loss of melanocortin 1 receptor (MC1R) function and found that the increased thresholds are melanocyte dependent but melanin independent. MC1R loss of function decreases melanocytic proopiomelanocortin transcription and systemic melanocyte-stimulating hormone (MSH) levels in the plasma of red-haired (Mc1re/e) mice. Decreased peripheral α-MSH derepresses the central opioid tone mediated by the opioid receptor OPRM1, resulting in increased nociceptive thresholds. We identified MC4R as the MSH-responsive receptor that opposes OPRM1 signaling and the periaqueductal gray area in the brainstem as a central area of opioid/melanocortin antagonism. This work highlights the physiologic role of melanocytic MC1R and circulating melanocortins in the regulation of nociception and provides a mechanistic framework for altered opioid signaling and pain sensitivity in red-haired individuals.

Robinson KC, Kemény LV, Fell GL, Hermann AL, Allouche J, Ding W, Yekkirala A, Hsiao JJ, Su MY, Theodosakis N, Kozak G, Takeuchi Y, Shen S, Berenyi A, Mao J, Woolf CJ, Fisher DE. Reduced MC4R signaling alters nociceptive thresholds associated with red hair. Sci Adv. 2021 Apr 2;7(14):eabd1310. doi: 10.1126/sciadv.abd1310. PMID: 33811065.
https://advances.sciencemag.org/content/7/14/eabd1310

Rubbish-raiding parrots take lessons from co-conspirators.
[...]
Before 2018, cockatoo dumpster diving had only been reported in three suburbs. By late 2019, it had spread to 44 out of nearly 500 in the survey. And the spread had a clear pattern: It started near those three, original suburbs and trailed off as locations got farther and farther away, the researchers report today in Science. That suggests the birds were learning from one another and spreading the behavior through the city, Klump says. In one distant neighborhood, dumpster diving seemed to pop up on its own, suggesting that a new batch of cockatoos had hit on the strategy independently. There are also anecdotal reports of the behavior elsewhere in Australia, Klump says.

To get a clearer picture of what the raven-size cockatoos were doing, the researchers caught and marked 486 birds in some of the garbage can–opening hot spots. After filming 160 successful dives, they noted several common steps: First, a bird lifted the can’s lid at the front corner with its bill; then, they held it slightly open while waddling toward the hinges; finally, they flipped up the lid suddenly so that it fell open and yielded its treasure trove of trash.

Individual birds used slightly different techniques: Some held the handle of the can’s lid, whereas others just held onto the lid itself. And some held it with both bill and foot, whereas others just used the bill. The farther apart the dives were geographically, the more the birds’ techniques differed. “That really means that they socially learn, not just that you can open [a garbage can], but how to open it,” Klump says. It also suggests local knowledge about dumpster diving is passed along, creating “regional subcultures.” Local cultures, or “dialects,” have been found in parrot calls, but this is the first time it has been found in parrot foraging. That means cockatoos join a select group of animals, like some primates and whales, that have culture in both communication and food gathering.

The results are exciting—and the number of birds the researchers caught and marked for the study is “astronomical,” Logan says: “Studying culture in wild populations is extremely difficult, because you have to track the start and spread of an innovation.”

But Claudio Tennie, a cognitive scientist at the University of Tübingen, says the cockatoo culture conclusion is premature. It’s a “neat study,” he says, that does a good job showing the cockatoos learn from each other. But to show the birds have real cultures—the way humans have cultural differences in things like language or cooking—the researchers would have to clearly identify at least one can-opening sequence that is “locally unique,” he says. The researchers found that the sequences broadly differed with distance, but they didn’t show that any given technique was restricted to one place. “I like [the paper],” Tennie says. “But it’s not the full monty. It’s not like human culture—yet.”
https://www.sciencemag.org/news/2021/07/australia-s-cockatoos-are-masters-dumpster-diving-and-now-they-re-learning-each-other

Innovation and geographic spread of a complex foraging culture in an urban parrot
Klump BC, Martin JM, Wild S, HÖRSCH JK, Major RE, Aplin LM
Science  23 Jul 2021:
Vol. 373, Issue 6553, pp. 456-460
DOI: 10.1126/science.abe7808

Birds in the bin
It is by now well accepted that humans are not the only animal to have complex culture, and we have also found that ecological novelty can lead to cultural innovation. Klump et al. documented the emergence of an evolving set of behaviors in response to human-generated resources, specifically garbage bins, in sulphur-crested cockatoos. This finding both documents the existence and spread of complex foraging culture among parrots, a lineage known for high-level cognitive function, and illuminates how the spread of a cultural innovation can lead to regional distinct variations.

Abstract
The emergence, spread, and establishment of innovations within cultures can promote adaptive responses to anthropogenic change. We describe a putative case of the development of a cultural adaptation to urban environments: opening of household waste bins by wild sulphur-crested cockatoos. A spatial network analysis of community science reports revealed the geographic spread of bin opening from three suburbs to 44 in Sydney, Australia, by means of social learning. Analysis of 160 direct observations revealed individual styles and site-specific differences. We describe a full pathway from the spread of innovation to emergence of geographic variation, evidencing foraging cultures in parrots and indicating the existence of cultural complexity in parrots. Bin opening is directly linked to human-provided opportunities, highlighting the potential for culture to facilitate behavioral responses to anthropogenic change.

Trad rapide a écrit:Selon une étude, le métabolisme atteint son maximum à l'âge d'un an et s'effondre à partir de 60 ans
Par James Gallagher

Selon une analyse sans précédent de l'utilisation de l'énergie par l'organisme, la prise de poids à l'âge mûr ne peut être attribuée à un métabolisme défaillant.

L'étude, qui a porté sur 6 400 personnes, âgées de huit jours à 95 ans, dans 29 pays, suggère que le métabolisme reste "stable comme un roc" tout au long de la vie active.

Il atteint son maximum à l'âge d'un an, reste stable de 20 à 60 ans, puis décline inexorablement.
[...]
Le métabolisme, c'est la chimie nécessaire au fonctionnement de l'organisme.

Et plus le corps est gros - qu'il s'agisse de muscles développés ou d'un excès de graisse du ventre - plus il faudra d'énergie pour courir.

Les chercheurs ont donc modifié leurs mesures, en tenant compte de la taille du corps, afin de comparer le métabolisme des personnes "au kilo".

L'étude, publiée dans la revue Science, a mis en évidence quatre phases de la vie métabolique :
-de la naissance à l'âge d'un an, lorsque le métabolisme passe du même niveau que celui de la mère à un niveau supérieur de 50 % à celui des adultes au cours de la vie active
-un léger ralentissement jusqu'à l'âge de 20 ans, sans pic pendant tous les changements de la puberté
-pas de changement du tout entre 20 et 60 ans
-un déclin permanent, avec des baisses annuelles qui, à 90 ans, laissent le métabolisme 26 % plus bas qu'au milieu de la vie.
[...]
"Lorsque les gens parlent de métabolisme, ils pensent régime alimentaire et exercice physique - mais c'est plus profond que cela, on observe en fait le corps, les cellules, au travail", a déclaré le professeur Herman Pontzer, de l'Université Duke, à BBC News.

"Elles sont incroyablement occupées à un an et lorsque nous constatons des déclins avec l'âge, on voit les cellules cesser de fonctionner".
[...]
https://www.bbc.com/news/health-58186710

Il en est aussi question dans ce papier de vulgarisation :
https://www.sciencemag.org/news/2021/08/little-kids-burn-so-much-energy-they-re-different-species-study-finds
[...]
"Nous savons que les femmes enceintes brûlent plus de calories, mais elles brûlent plus d'énergie du simple fait qu'elles sont plus volumineuses", explique Mme Pontzer.

Le taux métabolique n'a pas non plus augmenté chez les adolescents affamés, ce qui rend les résultats contre-intuitifs. "Lorsque les enfants atteignent la puberté, il semble y avoir un pic important dans la quantité de calories qu'ils consomment", explique Pontzer. "Dans la trentaine et la quarantaine, les gens ont souvent l'impression de ralentir ; quand la ménopause arrive, on ralentit encore plus". Mais le taux métabolique ne change pas à ces moments-là. Les changements hormonaux, le stress, les maladies, la croissance et les niveaux d'activité influencent l'appétit, l'énergie et le poids corporel, dit-il.

Le Dr Pontzer suppose que le taux métabolique s'accélère chez les tout-petits parce que les changements liés au développement du cerveau, d'autres organes et du système immunitaire consomment beaucoup d'énergie. Et il ralentit chez les personnes âgées, car leurs organes rétrécissent et elles perdent de la matière grise dans leur cerveau.
Le cerveau en pleine croissance est probablement le principal suceur d'énergie chez les petits enfants, affirme l'anthropologue biologique Chris Kuzawa de l'Université Northwestern. Kuzawa n'a pas participé à cette étude, mais en 2014, son équipe a découvert que le cerveau des jeunes enfants consomme un pourcentage stupéfiant de 43 % de toute l'énergie utilisée par le corps.
[...]

L'étude en question :
Daily energy expenditure through the human life course
Herman Pontzer et tout plein d'autres
Science  13 Aug 2021:
Vol. 373, Issue 6556, pp. 808-812
https://science.sciencemag.org/content/373/6556/808

Trad rapide a écrit:Brain power
Vijay Balasubramanian

Le cerveau humain ne représente que 2 % du poids du corps, mais 20 % de sa charge métabolique (1⇓-3), et dépense 10 fois plus au gramme que le muscle. D'autre part, le cerveau parvient à produire de la poésie, à concevoir des vaisseaux spatiaux et à créer de l'art avec un budget énergétique de ∼20 W, une somme dérisoire si l'on considère que l'ordinateur sur lequel cet article est tapé nécessite 80 W. Alors, où l'énergie est-elle consommée dans le cerveau, à quoi sert-elle, pourquoi est-elle si coûteuse par rapport aux autres "coûts de la vie", et comment atteint-elle son efficacité énergétique par rapport au silicium artificiel ? De nombreux articles classiques ont étudié ces questions. Attwell et Laughlin (4) ont élaboré des estimations biophysiques détaillées suggérant que la signalisation neuronale et les effets postsynaptiques de la libération des neurotransmetteurs représentent ensemble 80 % de la consommation d'adénosine triphosphate (ATP) du cerveau, conclusions qui sont également étayées par la physiologie et l'anatomie globales des circuits neuronaux (5, 6). De nombreuses études ont exploré les conséquences structurelles et fonctionnelles de cette dépense pour la limitation de la taille du cerveau (7) et le changement d'échelle (8 ), les modèles de câblage efficaces (9), la signalisation analogique (potentiel gradué) par rapport à la signalisation numérique (spiking) (10), les codes neuronaux distribués (11⇓-13), la distribution du trafic d'informations le long des trajets nerveux et la distribution de leur taille (14⇓-16), ainsi que l'hétérogénéité et l'efficacité du calcul (17). Beaucoup de ces idées ont été synthétisées par Sterling et Laughlin (18) dans un ensemble de principes régissant la conception des cerveaux. Aujourd'hui, dans PNAS, Levy et Calvert (19) proposent une comptabilité fonctionnelle du budget énergétique du cerveau des mammifères, suggérant que la communication est beaucoup plus coûteuse que le calcul, et explorant les conséquences fonctionnelles pour l'organisation des circuits neuronaux.

Levy et Calvert (19) s'appuient sur la littérature antérieure en se concentrant principalement sur la puissance relative engagée dans les différents modes de traitement de l'information dans le cerveau humain, plutôt que sur les différents aspects de la fonction cellulaire. Ils établissent une distinction essentielle entre la communication et le calcul. La "communication" désigne, en général, le transport d'informations, éventuellement codées d'une manière ou d'une autre, d'un site à un autre sans transformation de la représentation, extraction des caractéristiques saillantes ou mise en correspondance avec des décisions ou des résultats. Un exemple dans le cerveau est le transport d'informations visuelles, inchangées, le long du nerf optique, de l'œil au cerveau central. Le "calcul", un concept plus subtil, est généralement compris en termes de transformation entrée-sortie. Levy et Calvert, s'appuyant sur les travaux antérieurs de Levy, considèrent que chaque neurone effectue une "estimation ou une prédiction microscopique" des variables latentes de son entrée et qu'il code cette sortie dans des intervalles d'impulsion (IPI), c'est-à-dire dans la synchronisation relative des potentiels d'action utilisés dans la signalisation par la plupart des neurones. L'estimation et la prédiction sont des cadres suffisamment généraux pour englober d'autres conceptions du calcul neuronal (par exemple, les neurones en tant que systèmes dynamiques ou portes logiques), et aussi pour englober le rôle joué par des neurones uniques au sein de réseaux chargés d'exécuter une fonction de calcul. De même, le codage de l'information dans les IPI inclut d'autres possibilités telles que les codes de taux et les codes de motifs comme cas spécifiques. Ainsi, un exemple de "calcul" par un neurone dans le cerveau pourrait être la signalisation par une simple cellule de V1 de la présence d'une barre horizontale dans l'entrée visuelle.

En adoptant cette perspective, les auteurs concluent que les processus biophysiques soutenant la communication consomment 35 fois plus d'énergie (molécules d'ATP par seconde en unités biologiques pertinentes, ou joules par seconde en unités physiques) que les processus soutenant le calcul (19). Ils arrivent à cette conclusion en additionnant le coût en ATP pour récupérer les gradients ioniques des courants excitateurs par IPI impliqués dans le calcul par rapport aux coûts tels que les potentiels de repos axonaux, les potentiels d'action et le recyclage des vésicules impliqués dans la communication. Cette grande différence formalise les résultats implicites de la réf. 4, dont les auteurs ont montré que les potentiels d'action et leurs effets postsynaptiques dominent la consommation d'énergie dans le cerveau. Dans une autre ligne de preuve de la réf. 15, la distribution des mitochondries dans les neurones suit les taux de tir et la transmission synaptique, de sorte que l'épaisseur des axones peut être largement déterminée par la nécessité d'alimenter les terminaux synaptiques dont l'utilisation consomme 65 % du budget énergétique du cerveau des mammifères (20). Ces processus coûteux des réf. 4 et 15 décrivent la communication, et non le calcul, dans le cadre de la réf. 19. Il est intéressant de noter que Levy et Calvert estiment également que 27 % de la dépense énergétique corticale est consacrée aux coûts associés à la synaptogenèse, tels que la croissance via la polymérisation de l'actine, la synthèse et l'incorporation de la membrane, et le transport intracellulaire associé. Cet affinement intéressant des bilans énergétiques précédents suggère que plus d'un quart du coût énergétique de la possession d'un cerveau sert à faciliter l'apprentissage continu, ce qui correspond à notre impression qualitative de la finalité de cet organe.

En termes physiques, Levy et Calvert (19) ont calculé que la matière grise corticale consomme environ 3 W d'énergie sur les 17 à 20 W provenant de l'absorption du glucose dans le cerveau (1, 2), dont 10 % restent inutilisés en fonctionnement normal. Environ 3 fois plus (∼9W) est perdue en chaleur, et le reste alimente le reste du cerveau. L'estimation de la consommation d'énergie de la matière grise (∼3W) est conforme aux travaux antérieurs de Lennie (21), qui, en utilisant des données disponibles il y a vingt ans, a trouvé une répartition différente du budget énergétique, suggérant que 50 % de l'énergie est consacrée à des processus indépendants de l'activité électrique neuronale (c'est-à-dire le calcul et la communication). [...]
[...]
PNAS August 10, 2021 118 (32) e2107022118;
https://doi.org/10.1073/pnas.2107022118

Le papier dont il est question :
Communication consumes 35 times more energy than computation in the human cortex, but both costs are needed to predict synapse number
William B Levy, Victoria G. Calvert
Proceedings of the National Academy of Sciences May 2021, 118 (18) e2008173118;
https://doi.org/10.1073/pnas.2008173118

Trad rapide a écrit:Les langues africaines vont recevoir davantage de termes scientifiques sur mesure
Sarah Wild

De nombreux mots communs à la science n'ont jamais été écrits dans les langues africaines. Des chercheurs de toute l'Afrique ont décidé de changer cela.

Il n'y a pas de mot original isiZulu pour dinosaure. Les microbes sont appelés amagciwane, mais il n'existe pas de mots distincts pour les virus ou les bactéries. Un quark se dit ikhwakhi (prononcé kwa-ki) ; il n'existe pas de terme pour désigner le décalage vers le rouge. Les chercheurs et les vulgarisateurs scientifiques qui utilisent cette langue, parlée par plus de 14 millions de personnes en Afrique australe, ont du mal à se mettre d'accord sur les mots qui désignent l'évolution.

L'IsiZulu est l'une des quelque 2 000 langues parlées en Afrique. La science moderne a ignoré l'écrasante majorité de ces langues, mais une équipe de chercheurs africains veut désormais changer cela.

Un projet de recherche intitulé "Decolonise Science" prévoit de traduire 180 articles scientifiques du serveur de prépublications AfricArXiv dans six langues africaines : l'isiZulu et le sotho du Nord en Afrique australe ; le haoussa et le yoruba en Afrique de l'Ouest ; le luganda et l'amharique en Afrique de l'Est.

Ces langues sont collectivement parlées par environ 98 millions de personnes. Au début du mois, AfricArXiv a lancé un appel aux auteurs souhaitant que leurs articles soient pris en considération pour la traduction. La date limite est fixée au 20 août.
[...]
"Nous sommes conscients que les milliers de langues africaines sont actuellement sous-représentées dans les logiciels de traduction", a déclaré un porte-parole de Google à Nature. Le géant technologique souhaite étendre Google Translate à d'autres langues africaines, notamment le twi, l'ewe, le baoulé, le bambara, le fula, le kanuri, le krio, l'isoko, le luganda, le sango, le tiv et l'urhobo. Cependant, il a besoin de "locuteurs de ces langues pour nous aider à améliorer la qualité de nos traductions" afin qu'elles puissent être intégrées au service.

"L'idée maîtresse est l'appropriation culturelle de la science", explique M. Biyela. M. Abbott et lui-même estiment qu'il est essentiel de décoloniser la science en permettant aux gens de faire des recherches et de parler de la science dans leur propre langue. Pour l'instant, il est possible d'utiliser les langues africaines pour parler de politique et de sport, mais pas de science, explique M. Biyela.
[...]
https://doi.org/10.1038/d41586-021-02218-x

Trad rapide a écrit:Comprendre les perceptions internationales de la gravité des contenus préjudiciables en ligne

Résumé
Les plateformes de médias sociaux en ligne sont constamment confrontées à des contenus préjudiciables tels que la désinformation et la violence, mais la manière de modérer et de hiérarchiser efficacement ces contenus pour des milliards d'utilisateurs mondiaux aux origines et aux valeurs différentes représente un défi. Par le biais d'une enquête internationale menée auprès de 1696 utilisateurs d'Internet dans huit pays différents, cette étude empirique examine la façon dont les utilisateurs internationaux perçoivent les contenus préjudiciables en ligne, ainsi que les similitudes et les différences dans leurs perceptions. Nous avons constaté que, d'un pays à l'autre, la gravité perçue suit systématiquement une croissance exponentielle à mesure que le contenu préjudiciable devient plus grave, mais que les contenus préjudiciables perçus comme plus ou moins graves varient considérablement. Nos résultats remettent en question le statu quo de la modération du contenu des plateformes, qui consiste à utiliser une approche unique pour régir les utilisateurs internationaux, et fournissent des indications sur la manière dont les plateformes peuvent souhaiter hiérarchiser et personnaliser leur modération du contenu préjudiciable.

[...]
La courbe en forme de U inversé de la figure 5 montre que les pays sont plus d'accord sur les dommages les plus graves et les moins graves, mais qu'ils sont plus en désaccord vers le milieu (la "vente de marijuana" ayant l'écart type le plus important (ET = 15,57), et "l'abus d'engagement" (qui apparaît souvent dans les clickbaits) ayant l'écart type le plus faible (ET = 0,46)).

Figure 5 ici : https://journals.plos.org/plosone/article/figure?id=10.1371/journal.pone.0256762.g005
[...]

Discussion et conclusion :

Jiang JA, Scheuerman MK, Fiesler C, Brubaker JR (2021) Understanding international perceptions of the severity of harmful content online. PLoS ONE 16( 8 ): e0256762.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0256762

Trad rapide a écrit:[...]

Figure 1. Budgets énergétiques et hypothèses concurrentes
[...]

[...] les humains menant une vie moderne typique - qui ne se livrent pas à des niveaux d'activité exceptionnels ou ne connaissent pas de pénuries alimentaires chroniques - présentent une compensation assez forte entre l'énergie qu'ils dépensent en activité et celle qu'ils consacrent aux processus métaboliques de base ; à long terme, plus d'un quart des calories supplémentaires brûlées par les gens pendant l'activité ne se traduisent pas par des calories supplémentaires dépensées ce jour-là. On peut supposer qu'une telle compensation aurait été adaptative pour nos ancêtres, car elle minimisait les demandes énergétiques alimentaires et réduisait donc le temps nécessaire à la recherche de nourriture, ce qui pouvait avoir pour avantage de réduire l'exposition à la prédation. Cependant, il est potentiellement inadapté pour l'homme moderne qui fait de l'exercice pour essayer de brûler l'excès de nourriture consommée, étant donné la chaîne d'association qui relie les aliments à haute densité calorique à un apport énergétique plus important, à l'obésité et aux maladies qui y sont liées.
[...]

Energy compensation and adiposity in humans
Careau, Vincent et al.
Current Biology
https://doi.org/10.1016/j.cub.2021.08.016

Trad rapide a écrit:Scepticisme et défiance : Évaluer la crédibilité et les représentations de la science

Résumé
Depuis les années 1970, on s'intéresse de plus en plus à la manière dont les individus s'approprient les connaissances scientifiques, intérêt qui a été récemment renforcé par des questions de société telles que la mise en circulation des vaccins et le scepticisme à l'égard du réchauffement climatique. Face aux conséquences sanitaires et sociales de la défiance à l'égard des connaissances scientifiques, il est urgent de disposer d'outils permettant de mesurer l'acceptation ou le rejet des connaissances scientifiques, tout en comprenant plus finement les processus en jeu. C'est l'objet de cet article. Ainsi, nous avons mené 4 études empiriques pour valider l'échelle de crédibilité de la science du point de vue d'une population française, qui vise à évaluer la crédibilité que les individus attribuent à la science et à évaluer empiriquement le lien qui peut exister entre les différents niveaux de crédibilité attribués à la science et les représentations sociales de la science. Les études 1a et 1b ont démontré la bonne validité structurelle, la bonne fidélité (homogénéité et stabilité temporelle) et la bonne validité de critère de la version française de l'échelle. Dans l'étude 2, nous avons observé les mêmes qualités psychométriques de la version française de l'échelle. Nous avons également noté une structuration de la représentation sociale de la science en fonction de l'âge (Facteur 1) et de la crédibilité attribuée à la science (Facteur 2). Nos résultats soulèvent également la question des moyens d'intervention possibles pour promouvoir une meilleure perception de la science.

Tavani JL, Piermattéo A, Lo Monaco G, Delouvée S. Skepticism and defiance: Assessing credibility and representations of science. PLoS One. 2021 Sep 1;16(9):e0250823.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0250823

Trad rapide a écrit:Le premier essai en plein champ de blé génétiquement modifié en Europe a reçu le feu vert des autorités réglementaires britanniques. Les chercheurs ont utilisé CRISPR pour réduire les niveaux d'un acide aminé, l'asparagine, qui se transforme en acrylamide, un produit chimique cancérigène, lorsque le pain est frit, cuit ou grillé. À la suite de la sortie du Royaume-Uni de l'Union européenne, cet essai marque une rupture avec les règles européennes qui assimilent l'édition de gènes à une modification génétique, laquelle est effectivement interdite dans l'Union.
https://www.nature.com/articles/d41586-021-02389-7
qui parle de :
https://www.fwi.co.uk/arable/wheat/rothamsted-gets-green-light-to-trial-gene-edited-wheat
discuté en amont ici :
https://www.nature.com/articles/d41586-021-00672-1

Trad rapide a écrit:Le vaccin ADN COVID de l'Inde est une première mondiale - d'autres sont à venir
Le vaccin ZyCoV-D annonce une vague de vaccins à ADN pour diverses maladies qui font l'objet d'essais cliniques dans le monde entier.
Smriti Mallapaty
[...]
Le ZyCoV-D a été développé par la société pharmaceutique indienne Zydus Cadila, dont le siège est à Ahmedabad. Le 20 août, l'autorité indienne de réglementation des médicaments a autorisé le vaccin pour les personnes âgées de 12 ans et plus. Le chiffre d'efficacité de 67% provient d'essais impliquant plus de 28 000 participants, qui ont vu 21 cas symptomatiques de COVID-19 dans le groupe vacciné et 60 parmi les personnes ayant reçu un placebo.

Le ZyCoV-D contient des brins d'ADN circulaires appelés plasmides, qui codent pour la protéine spike du SRAS-CoV-2, ainsi qu'une séquence promotrice permettant d'activer le gène. Une fois que les plasmides pénètrent dans les noyaux des cellules, ils sont convertis en ARNm, qui se déplace vers le corps principal de la cellule, le cytoplasme, et est traduit en la protéine spike elle-même. Le système immunitaire de l'organisme déclenche alors une réaction contre la protéine et produit des cellules immunitaires adaptées qui peuvent éliminer les infections futures. Les plasmides se dégradent généralement en quelques semaines ou mois, mais l'immunité demeure.

M. Weiner précise que les vaccins à ADN et à ARNm sont en cours de développement depuis les années 1990. La difficulté pour les vaccins à ADN est qu'ils doivent atteindre le noyau cellulaire, contrairement aux vaccins à ARNm, qui ne doivent atteindre que le cytoplasme, explique M. Jameel. Ainsi, pendant longtemps, les vaccins à ADN ont eu du mal à induire des réponses immunitaires puissantes lors des essais cliniques, ce qui explique pourquoi leur utilisation en tant que vaccins n'a été autorisée que chez les animaux, comme les chevaux, jusqu'à présent.

Pour résoudre ce problème, le ZyCoV-D est déposé sous la peau, et non dans les profondeurs du tissu musculaire. La zone située sous la peau est riche en cellules immunitaires qui absorbent les corps étrangers, tels que les particules vaccinales, et les traitent. "Cela permet de capturer l'ADN beaucoup plus efficacement que dans le muscle", explique M. Jameel. Fait inhabituel, le vaccin est administré à l'aide d'un dispositif sans aiguille pressé contre la peau, ce qui crée un flux de fluide fin et à haute pression qui perfore la surface et est moins douloureux qu'une injection.

Mais bien qu'il soit plus puissant que les vaccins à ADN précédents, le ZyCoV-D nécessite un minimum de trois doses pour atteindre son efficacité initiale. Selon M. Jameel, cela risque d'ajouter au défi logistique que représente l'administration du vaccin pendant la pandémie actuelle.

Bien que l'efficacité du ZyCoV-D semble être inférieure aux 90 % ou plus atteints par certains vaccins à ARNm, les chiffres ne sont pas comparables, affirme Jameel. Les essais du ZyCoV-D menés en Inde au début de l'année ont été réalisés alors que la variante Delta du SRAS-CoV-2 était la variante dominante en circulation, alors que les essais antérieurs du vaccin à ARNm ont été réalisés lorsque des variantes moins transmissibles circulaient. "L'efficacité est essentiellement contre la variante Delta, ce qui est plutôt bon", dit-il.

Certains chercheurs ont critiqué un manque de transparence dans le processus d'approbation, car aucun résultat d'essai à un stade avancé n'a encore été publié. Zydus Cadila affirme que l'essai est toujours en cours et qu'elle soumettra l'analyse complète pour publication sous peu. La société indique que les premières doses commenceront à être administrées en Inde en septembre et qu'elle prévoit de produire jusqu'à 50 millions de doses d'ici le début de l'année prochaine.


Plusieurs autres vaccins à ADN sont en cours de développement contre le COVID-19, en utilisant une variété d'antigènes et de mécanismes d'administration (voir "Vaccins à ADN dans les essais cliniques"). Deux d'entre eux sont entrés dans la phase finale des essais : l'un par la société japonaise AnGes, basée à Osaka ; l'autre, que Weiner a aidé à développer, par Inovio Pharmaceuticals à Plymouth Meeting, Pennsylvanie. Inovio s'injecte sous la peau et utilise un appareil qui frappe la peau avec de courtes impulsions électriques pour former des pores dans les cellules à travers lesquels le vaccin peut se glisser.

Plus d'une demi-douzaine de vaccins à ADN contre le COVID-19 en sont aux premiers stades des essais, dont un mis au point par la société de biotechnologie sud-coréenne GeneOne Life Science à Séoul, et un autre auquel Richmond participe, développé par la société thaïlandaise BioNet à Bangkok. Ce vaccin fait l'objet d'un essai de phase I en Australie.

Mais Richmond s'attend à ce que de nombreux autres vaccins à ADN voient le jour, ciblant des maladies pour lesquelles il n'existe actuellement aucun vaccin - du cytomégalovirus, qui peut être transmis aux bébés pendant la grossesse, au virus respiratoire syncytial. Des vaccins à ADN sont également testés ou développés pour la grippe, le papillomavirus humain, le VIH et le Zika.

Les vaccins à ADN peuvent stocker beaucoup d'informations, ce qui signifie qu'ils peuvent coder de grandes protéines complexes, voire des protéines multiples. Selon M. Weiner, cela les rend prometteurs en tant que vaccins anticancéreux, une possibilité qu'il explore dans le cadre de ses propres recherches.

"C'est une période très excitante pour les technologies génétiques. Elles ont enfin l'occasion de montrer ce qu'elles peuvent faire", déclare-t-il.

doi: https://doi.org/10.1038/d41586-021-02385-x

Trad rapide a écrit:La machine obsolète qui entrave la lutte contre le Covid-19
[...]

L'HISTOIRE DU FAX

L'histoire du fax remonte à 1842, lorsque l'inventeur écossais Alexander Bain a créé et breveté un appareil capable de scanner un message écrit avec une encre spéciale sur une surface métallique et de le transmettre à distance, en utilisant un circuit télégraphique.

Aucune des machines de Bain n'a connu un succès particulier. C'est le prêtre et inventeur italien Giovanni Caselli qui, en 1863, a construit le premier télécopieur commercial, d'abord utilisé en France.

Au début du 20e siècle, les télécopieurs étaient prisés par plusieurs professions, notamment les militaires, qui s'en servaient pour envoyer rapidement des cartes et des graphiques à destination et en provenance des avions, et les journaux, qui les utilisaient pour envoyer des photographies en vue d'une publication urgente.

Dans les années 1970, les Japonais ont popularisé cette technologie, qui est devenue un outil indispensable pour les entreprises. À la fin du XXe siècle, les télécopieurs sont devenus omniprésents en raison de la fiabilité et de la rapidité de leur transmission d'informations.

En 2000, le rôle du fax dans les affaires était en déclin, les entreprises se tournant vers le courrier électronique et l'internet pour partager des informations. Mais dans d'autres secteurs, comme les soins de santé et l'immobilier, le télécopieur s'est obstinément accroché.

[...]
https://www.bbc.com/future/article/20210903-how-covid-19-could-finally-be-the-end-of-the-fax-machine

Spoiler:

p2m a écrit:

[...]
Outre s, d'autres lettres amuïes ont été représentées par un accent circonflexe. C'est le cas des voyelles en hiatus dont la première ne se prononçait plus ou qui s'était contractée avec la suivante :

aage → âge ;
baailler → bâiller ;
piquure → piqûre ;
saoul → soûl (les deux orthographes étant admises) ;
Le cas est fréquent dans des mots où -u est issu d'anciennes diphtongues médiévales ëu /ey/ (le tréma n'est pas écrit à l'origine) venues à se prononcer /y/ mais écrite de manière conservatrice eu. Il faut attendre la fin du xviiie siècle pour que la graphie, hésitant entre ëu (le tréma sert aussi, en français, à marquer une voyelle muette), eu ou û, se fixe sur û :

deu → dû (de devoir) ;
meu → mû (de mouvoir) ;
creu → crû (de croître) ;
seur → sûr ;
cruement → crûment ;
meur → mûr.

Certaines formes ont été concernées qui, aujourd'hui, ne prennent plus l'accent : seü → sû → su (de savoir) ou peu → pû → pu. Pour les verbes, en vertu de l'analogie, les participes passés en -u ne prennent un accent que pour éviter les homographies possibles (voir plus bas).

Dans le cas du mot dîme, l'accent circonflexe provient de l'amuïssement d'un x :

dixme → dîme : la 4e édition du Dictionnaire de l'Académie française (1762) note qu'« on ne prononce point l'X qui ne sert qu'à allonger la première syllabe »7. L'édition suivante (1798) adoptera la graphie dîme.
[...]
https://fr.wikipedia.org/wiki/Accent_circonflexe_en_fran%C3%A7ais

Spoiler:

Cerveau : dépister précocement l'autisme par IRM ?

En examinant par IRM le cerveau d'enfants à risque de développer des troubles du spectre autistique, des chercheurs pensent avoir trouvé un marqueur cérébral permettant de les dépister dès l'âge de 1 an.

AUTISME. Détecter des troubles du spectre autistique n'est aujourd'hui possible qu'à partir de la deuxième année de l'enfant. Le diagnostic repose en effet sur le repérage d'un certain nombres de signes comportementaux difficilement interprétables avant : développement du langage, de la motricité, comportements extrêmes ou répétitifs... Mais plusieurs équipes à travers le monde travaillent à l'identification de marqueurs cérébraux permettant de caractériser un autisme à partir d'une observation directe du cerveau. L'objectif étant notamment de pouvoir dépister ces troubles le plus tôt possible afin d'adapter au plus vite le cadre dans lequel l'enfant se développera.

80% de succès à la "prédiction"

Dans cette optique, une équipe américaine vient de publier dans Nature des travaux démontrant la possibilité de se servir de l'imagerie par résonance magnétique (IRM) pour détecter l'autisme chez des enfants âgés d'à peine 1 an. Tout du moins chez les membres d'une fratrie dont au moins un membre est déjà touché par des troubles du spectre autistique (TSA). L'implication de facteurs génétiques dans la survenue de l'autisme fait que les frères et sœurs d'un enfant touché sont plus à risque. Les chercheurs de l'université de Washington et de l'université de Caroline du Nord (États-Unis) ont ainsi obtenu des résultats encourageants — 80% de succès à la "prédiction" — auprès d'une centaine d'enfants testés.

Plus précisément, 106 enfants à risque, issus d'une fratrie avec au moins un cas d'autisme, et 42 sans sur-risque identifié ont été inclus à l'étude. Tous ont été suivis et soumis à des observations du cerveau par IRM à l'âge de 6, 12 et 24 mois. Grâce à des mesures de la surface et du volume du cerveau ainsi que de l'épaisseur du cortex, les chercheurs ont constaté que les enfants qui deviendraient autistes présentaient une hyper-extension de la surface du cerveau entre 6 et 12 mois. Une augmentation absente chez les enfants ayant des frères et sœurs autistes qui n'ont pas développé la maladie.

Pour les chercheurs, "ces observations démontrent que des modifications précoces du cerveau surviennent durant la période où les premiers comportements autistiques émergent". Une telle découverte est d'importance, car adapter la communication avec les enfants autistes permet de limiter la sévérité des symptômes.

j'ai rien compris à la vidéo sur le hasard: